EZ
Size: a a a
2020 October 18
AZ
Ну если все версии прописаны почему бы и нет
ну... многие хостят код эксклюзивно на своих серверах. и тогда, что есть у тебя номер версии, что нет...
EZ
ну... многие хостят код эксклюзивно на своих серверах. и тогда, что есть у тебя номер версии, что нет...
Эм? Допустим есть код на гитхабе с полным окружением, какая разница кто его где хостил?
AZ
в том числе из-за лицензионных ограничений. но как только уходит студент/аспирант, который это поддерживал...
AZ
Эм? Допустим есть код на гитхабе с полным окружением, какая разница кто его где хостил?
ну и как бы гитхаб - всего-лишь коммерческий сервис. мы уже много раз видели, как тот же гугл убивал свои даже популярные сервисы
EZ
ну и как бы гитхаб - всего-лишь коммерческий сервис. мы уже много раз видели, как тот же гугл убивал свои даже популярные сервисы
Если все что хостится на гитхабе исчезнет, нам будет не до биоинформатики
AZ
Если все что хостится на гитхабе исчезнет, нам будет не до биоинформатики
кстати, у того же гитхаба уже сильно менялись, например, схемы доступа к ресурсам. регулярно на натыкаюсь на старые проиндексированные ссылки на гитхаб, которые отдают 404
AZ
Если все что хостится на гитхабе исчезнет, нам будет не до биоинформатики
ну ничо, гуглкод то умер. а на нем тоже миллион проектов жил)
EZ
ну ничо, гуглкод то умер. а на нем тоже миллион проектов жил)
Ну всегда можно в arctic vault залезть и достать если нужно старье
MF
в том числе из-за лицензионных ограничений. но как только уходит студент/аспирант, который это поддерживал...
Лицензия это фактор, согласна
Ну вот сделал кто-нибудь РНК сек в 2018, использовал kallisto и deseq2, в чем проблема?
Я недавно старалась воспроизвести ресерч, в котором тренировали модель, так не было выложено ни нормального инпута, ни самого кода
Остается верить авторам на слово или убивать личное время на попытки разобраться и письма, зачем так
Ну вот сделал кто-нибудь РНК сек в 2018, использовал kallisto и deseq2, в чем проблема?
Я недавно старалась воспроизвести ресерч, в котором тренировали модель, так не было выложено ни нормального инпута, ни самого кода
Остается верить авторам на слово или убивать личное время на попытки разобраться и письма, зачем так
O
пайплайны, да. и в докер, конечно, все завернуть. ах, извините, сами докер контейнеры спустя год-два фиг там развернешь.
А в чем траблы с контейнерами? Если их билдить не надо?
EZ
Maria Firuleva
Лицензия это фактор, согласна
Ну вот сделал кто-нибудь РНК сек в 2018, использовал kallisto и deseq2, в чем проблема?
Я недавно старалась воспроизвести ресерч, в котором тренировали модель, так не было выложено ни нормального инпута, ни самого кода
Остается верить авторам на слово или убивать личное время на попытки разобраться и письма, зачем так
Ну вот сделал кто-нибудь РНК сек в 2018, использовал kallisto и deseq2, в чем проблема?
Я недавно старалась воспроизвести ресерч, в котором тренировали модель, так не было выложено ни нормального инпута, ни самого кода
Остается верить авторам на слово или убивать личное время на попытки разобраться и письма, зачем так
ну мне кажется в итоге мы должны прийти к тому что статьи с доступным кодом популярнее статей без кода тем самым мотивируя авторов публиковать код нормально
MF
ну мне кажется в итоге мы должны прийти к тому что статьи с доступным кодом популярнее статей без кода тем самым мотивируя авторов публиковать код нормально
возможно, но популярность это какая-то неопределенная вещь. в идеале на этапе ревью, мне кажется, смотреть на всё это
EZ
Maria Firuleva
возможно, но популярность это какая-то неопределенная вещь. в идеале на этапе ревью, мне кажется, смотреть на всё это
Ну такое, требовать от ревьюера запускать код тоже сомнительно
EZ
То есть вот в мл код это прям тренд но его очень редко даже открывают, не то что запускают, по ощущениям
MF
Ну такое, требовать от ревьюера запускать код тоже сомнительно
в существующей системе да :( ну хотя бы проверить, что он выложен, внутри нет странных абсолютных путей, какое-то минимальное code quality
MF
То есть вот в мл код это прям тренд но его очень редко даже открывают, не то что запускают, по ощущениям
а можете предположить, почему так? я думала, в мл наоборот людям интересно посмотреть на чужой код, чтобы потенциально улучшить свой
в идейном плане
в идейном плане
EZ
Maria Firuleva
в существующей системе да :( ну хотя бы проверить, что он выложен, внутри нет странных абсолютных путей, какое-то минимальное code quality
Ну это не работа ревьюера. В идеале он должен использовать код чтобы ревьюить статью. Ревьюить код он не должен и может не уметь
T
Maria Firuleva
а можете предположить, почему так? я думала, в мл наоборот людям интересно посмотреть на чужой код, чтобы потенциально улучшить свой
в идейном плане
в идейном плане
учёный - это не кодер, у него научные задачи.