Как можно извлечь еще ОДИН прайт, не заменяя предыдущие, тем более которые неправильно автоматически выделены?
Пользуйся Texture Packer
Он может экспортировать *.Paper2D файлы с описанием разметки атласа
Эти файлы при импорте в UE создают сразу набор спрайтов, ориентируясь на нейминг внутри Texture Packer проекта
Если ты изменишь/добавишь/по другому расставишь спрайты в Texture Packer, тебе просто нужно будет заново экспортировать *.Paper2D файл и реимпортировать в UE. UE автоматом подхватит по спрайты с теми же именами и все обновит