OK
Потому что форматов миллион, они постоянно меняются, и плодятся новые
Size: a a a
2021 July 07
EZ
Ну так это не каждый раз обработку всех форматов, а один раз каждого?
OK
Это они делают не в рамках основных обязанностей. Иначе они называются не ученые, а научные программисты
OK
Или даже не очень научные, а просто
G
вывод других тулов (скажем вариант коллеров в формате VCF) должен следовать спецификации VCF. должен. но не обязан.
всего можно использовать скажем 5 популярных вариант коллеров.
вместо того чтобы писать тул под вывод именно того коллера который использует конкретно ваша лаба - можно писать продукт для людей и тогда нужно тестировать на всех 5ти тулах.
полчаса => 10 часов
всего можно использовать скажем 5 популярных вариант коллеров.
вместо того чтобы писать тул под вывод именно того коллера который использует конкретно ваша лаба - можно писать продукт для людей и тогда нужно тестировать на всех 5ти тулах.
полчаса => 10 часов
EZ
Подразумевается что чтение вывода коллера пишется раз в неделю? Или это 10 часов на 5 лет пхд?)
АС
Т.е. если я напишу программу, которая мне поможет с обработкой данных. Соответственно, произведу новые знания. После чего поделюсь этой программой, чтобы народ мог повторить мои результаты, то я буду программистом, учёным, или и тем, и тем.
G
we just started =) помимо вариант коллера файлы могут быть по-разному postprocessed...есть еще несколько популярных тулов для аннотации...5x3=15...
Е
Как в описании напишешь, тем и будешь :)
OK
Нет, программа — это не знания. Знания, которые вы произведёте, вы напишете в диссер и станете пхд, а программой поделитесь на гитхабе и не получите за это ничего, кроме issues)))
АС
Программа - это просто программа. Я про результаты, которые я получу при помощи этой программы. Т.е. я произведу новые знания при помощи программы.
G
у меня было не раз что мой тул отрабатывает на 10 тысячах файлах из сотен тысяч строк каждый и падает на 10ти тысячном на строке номер 999 потому что там какой-то дичайше редкий вариант записан абсолютно срано, или какой-то серединный тул что-то не понял и не так записал - это биоинформатика, это норма
OK
Да. И у вас нет ни малейшей мотивации писать программу хорошо. Точнее, мотивация отрицательная, потому что качество обратно коррелирует со скоростью
АС
Зависит от размеров программы. Маленькие отрицательно, а вот большие положительно.
OK
Ваша позиция — 3-4 года, после этого ваша жизнь может категорически измениться. Большой софтвер проект вы не потянете)
G
В целом нужно чтобы программа работала на момент публикации, если вдруг через 3 дня уже не работает - ну, бывают в жизни огорчения
АС
Ну только если в индустрии. В академии один я не вытяну большой проект. Это нужно делать в команде. К тому же, его надо будет поддерживать. А денег на это не выделяют. В общем грустновато
M
Пакет на R, зачем софты))
OK
NAR требует поклясться, что ты 10 лет поддерживать будешь (и я честно поддерживала, а потом они решили, что /tmp чистить не надо)
G
Все требуют, а потом вы переходите в другой научный центр и предыдущий без предупреждения валит ваш сервак XD тру стори