Size: a a a

2020 October 20

АС

Александр Смирнов... in Science FYI
Правда теперь ещё меньше стало понятно, что писать в ответе, но я так понимаю, что надо указать на специфичность ферментов с указанием на огромное разнообразие белков
источник

L

Litto_ral in Science FYI
Александр Смирнов
Правда теперь ещё меньше стало понятно, что писать в ответе, но я так понимаю, что надо указать на специфичность ферментов с указанием на огромное разнообразие белков
Если нет никакого способа уточнить, я бы писала просто оба варианта. Тут все уже вроде верно подметили. Потому что "специфичность" ферментов, как выше указал Артур, это про субстраты, и она регулируется по разному (ещё кто-то же про коферемнты и модификации одного и того же фермента вроде упоминал, я читаю наискосок, сорян), а и иммуноспецифичность - это про Аг-Ат, и тут ферменты в целом от белков вообще отличаются примерно ничем, потому что это специфичность уровня 9-11 аминокислот, и иммуногенным может быть участок, к активному центру (специфичности) фермента, не имеющий никакого отношения
источник

АС

Александр Смирнов... in Science FYI
Litto_ral
Если нет никакого способа уточнить, я бы писала просто оба варианта. Тут все уже вроде верно подметили. Потому что "специфичность" ферментов, как выше указал Артур, это про субстраты, и она регулируется по разному (ещё кто-то же про коферемнты и модификации одного и того же фермента вроде упоминал, я читаю наискосок, сорян), а и иммуноспецифичность - это про Аг-Ат, и тут ферменты в целом от белков вообще отличаются примерно ничем, потому что это специфичность уровня 9-11 аминокислот, и иммуногенным может быть участок, к активному центру (специфичности) фермента, не имеющий никакого отношения
Спасибульки)
источник

L

Litto_ral in Science FYI
Александр Смирнов
Спасибульки)
источник

MS

Mike Sh in Science FYI
Litto_ral
Если нет никакого способа уточнить, я бы писала просто оба варианта. Тут все уже вроде верно подметили. Потому что "специфичность" ферментов, как выше указал Артур, это про субстраты, и она регулируется по разному (ещё кто-то же про коферемнты и модификации одного и того же фермента вроде упоминал, я читаю наискосок, сорян), а и иммуноспецифичность - это про Аг-Ат, и тут ферменты в целом от белков вообще отличаются примерно ничем, потому что это специфичность уровня 9-11 аминокислот, и иммуногенным может быть участок, к активному центру (специфичности) фермента, не имеющий никакого отношения
>- это про Аг-Ат, и тут ферменты в целом от белков вообще отличаются примерно ничем, потому что это специфичность уровня 9-11 аминокислот, и иммуногенным может быть участок,

Чтото все в кучу смешалось. Иммуногенность = способность распознать адаптивным иммунитетом коротких (10АА / 20АА) пептидов иммунной системой, и пространственная конформация этих пептидов совсем не зависит от их конформации внутри белка
источник

MS

Mike Sh in Science FYI
Александр Смирнов
Ну и получается, что ответ
Нет "иммунобиологически специфичных ферментов", за исключением возможно машинерии что рубит и кладет белки в HLA. Ферменты катализируют и проводят реакции, а те же TLR и антитела трудно записать в ферменты
источник

MS

Mike Sh in Science FYI
ИМХО тут очень странная постановка вопроса просто)
источник

L

Litto_ral in Science FYI
Mike Sh
>- это про Аг-Ат, и тут ферменты в целом от белков вообще отличаются примерно ничем, потому что это специфичность уровня 9-11 аминокислот, и иммуногенным может быть участок,

Чтото все в кучу смешалось. Иммуногенность = способность распознать адаптивным иммунитетом коротких (10АА / 20АА) пептидов иммунной системой, и пространственная конформация этих пептидов совсем не зависит от их конформации внутри белка
Вы, конечно, на коне, но иммуногенность это все равно потенциалтная  способность вызывать ответ, а не распознавать. То есть, свойства антигена. И ее сила связана и с размером, и с вторичной структурой.
Но спорить мне лень.
источник

MS

Mike Sh in Science FYI
Litto_ral
Вы, конечно, на коне, но иммуногенность это все равно потенциалтная  способность вызывать ответ, а не распознавать. То есть, свойства антигена. И ее сила связана и с размером, и с вторичной структурой.
Но спорить мне лень.
Ну для меня вероятность распознавания ~ способности вызвать ответ. Я к тому что В-клетки в герминальных центрах учатся на том что представлено на MHCII, а не на целых белках
источник

MS

Mike Sh in Science FYI
но согласен, с такой формулировкой вопроса спорить можно до бесконечности) лучшеб по Janeway спрашивали
источник

АС

Александр Смирнов... in Science FYI
Меня самого смутила формулировка вопроса, поэтому и написал
источник

MS

Mike Sh in Science FYI
тут скорее вопрос по истории науки, чтобы понимать что автор имел ввиду))
источник

MS

Mike Sh in Science FYI
из разряда что тут написано)
источник

AZ

Arthur Zalevsky in Science FYI
Mike Sh
Ну для меня вероятность распознавания ~ способности вызвать ответ. Я к тому что В-клетки в герминальных центрах учатся на том что представлено на MHCII, а не на целых белках
но ведь связывание != сигналлинг
источник

MS

Mike Sh in Science FYI
Arthur Zalevsky
но ведь связывание != сигналлинг
affinity я для простоты вынес за скобки естественно
источник

MS

Mike Sh in Science FYI
т.к. для Т-клеток не очень понятно - что лучше - один сильно аффинный вариант либо много средне аффинных, для В-клеток вообще affinity во времени меняется. Это очень упрощенная точка зрения, но ИМХО чем больше вероятность найти Т- / В-клетку что распознает данный антиген (с пороговым значением affinity) тем он более иммуногенный
источник

IZ

I Z in Science FYI
Иммуногенность - это сумма: связывания (с какой аффинностью? Зависит), распознавания как "угу, чет надо делать, игнорить не вариант", частоты встречи (ну, можно сказать, что "связывание и распознавание" зависит от частоты тоже), наличия и состава всяких сигнальных компонентов среды, которые направляют в какую-то сторону.

И да, В-клетки учатся таки на антигене, а вот лицензируются по тому, что на мнс2 выставили.
И это ещё T-cell independent мы не берём.
источник

IZ

I Z in Science FYI
А по сабжу исходному: может вообще что-то про абзимы имелось ввиду?
Ответ: специфичностью антитела
:))
источник

MS

Mike Sh in Science FYI
I Z
А по сабжу исходному: может вообще что-то про абзимы имелось ввиду?
Ответ: специфичностью антитела
:))
"The possibility of catalyzing a reaction by means of an antibody which binds the transition state was first suggested by William P. Jencks in 1969" кстати наверняка - актуально для года написания учебника [ http://www.dsch.univ.trieste.it/~benedetti/antibody_catalysis.htm ]
источник

IZ

I Z in Science FYI
Mike Sh
"The possibility of catalyzing a reaction by means of an antibody which binds the transition state was first suggested by William P. Jencks in 1969" кстати наверняка - актуально для года написания учебника [ http://www.dsch.univ.trieste.it/~benedetti/antibody_catalysis.htm ]
угу, вполне по времени.. и по смыслу… кажется 🙂
Но вообще, странный вопрос, канеш
источник