Recognition of pathogens relies on families of proteins showing great diversity. Here we construct maximum entropy models of the sequence repertoire, building on recent experiments that provide a nearly exhaustive sampling of the IgM sequences in zebrafish. These models are based solely on pairwise correlations between residue positions but correctly capture the higher order statistical properties of the repertoire. By exploiting the interpretation of these models as statistical physics problems, we make several predictions for the collective properties of the sequence ensemble: The distribution of sequences obeys Zipf’s law, the repertoire decomposes into several clusters, and there is a massive restriction of diversity because of the correlations. These predictions are completely inconsistent with models in which amino acid substitutions are made independently at each site and are in good agreement with the data. Our results suggest that antibody diversity is not limited by the sequences encoded in the genome…

Вы напутали всё. Материя это буквально всё, что рассматривает физика. Любой объект обладает энергией, если он вообще существует (даже в случае ваккума можно говорить об его энергетической плотности). Материя может иметь массу, а может не иметь. Фотон материален и не имеет массы.

Под веществом вот понимают ту часть материи, что массивна. Все фермионы, например. И что самое важное для нас - адроны, электроны.

Что значит "обладают ли энергией процессы"? На процессы может затрачивается энергия, или она может высвобождаться в их процессе. То есть процессы приводят к перераспределению энергии.

Про массу процесса не комментирую.

Я вообще это всё к чему. Судя по всему, вы не обладаете какими-то даже начальными знаниями в какой-либо из областей физики, но считаете, что вправе рассуждать о каких-то философских её основаниях. Зачем вы этим занимаетесь, зачем вовлекаете других? Разберитесь в базе и потом рассуждайте о таком.