Да скорее именно эйрфлоу, в последнем релизе если ты заливаешь скрипт то он сразу проверяет импорты судя по всему и если что-то не так то ругается
Ну, он проверяет весь скрипт, а ошибка загрузки дага возникает, когда проблема в скрипте, но, опять же, это ошибка python,а не airflow. Попробуйте в интерпретаторе с рабочей папки импортировать модули и его использовать.