>вывод облако тегов и саязей, вызов ссылаемого тега
Тэгов? Мы про мд?
>связи нужны как отдельное окно
Ссылки? Недостаточно будет того, что можно на любую ссылку кликнуть и она откроет то место, куда ссылается? Вам нужно всю паутину видеть?
>диаграмма как код нужна
mermaid?
А например отдельный визард для джекил проекта с поддержкой конфигов и ликвида, со своей настраиваемой ран конфигурацией? Код ассистанс, комплишен, навигация, рефакторинги, инспекции, интеншены (ту же таблицу сделать) или вообще редактор таблиц (боль мд)?
Лень про все писать по строчно. Отвечу в общем - то что есть недостаточно, иногда убого. Иногда оторвано от остального.
Да, md (а может и не его) в общем как вариант раширить средствамии yaml, и строить свою модель информации дока и модель доков проекта.
Мне же не только док и его строчка нужны, а сколько работа с информацией внутри него. С командой, от владельца до исполнителя. Ну и сам док контролировать так же. И доки проекта. Все три слоя, да еще и во времени. Например есть требования, внутри дока, мне требования как объект нужны. Но через ДОК. В общем все сложно, и просто. Посмотрите как должны работать проектироващики под заказ с чертежами до уровня объектов в них. Вот примерно это, но строчками и объектами ИТ в доках, от требований и схем до Кода.