Наверное в данном случае можно попробовать воспользоваться только какими-то веществами, которые будут флуоресцировать под действием рентгена.
Но тут такая штука - флуоресценция это засветка детектора, по сути, то есть если будет сильно светить, то просто локальная область пересветится, и ни морфологии, ни структуры тада
Для новичка - учебник Павла Певзнера, который идет к его курсу на курсере, Bioinformatics Algorithms: An active learning approach. А лучше вообще именно курс пройти, там можно бесплатно.
Упомянутый Дурбин тоже хорош, но он из учебников "старого образца". Когда тебе сначала вынесли мозг кучей формул, не особо утруждаясь сопроводить их иллюстрациями. Потом ты отошел, прочитал еще пару раз, и, наконец, понял.
Плюс там кучи современных тем нет, зато море времени уделено грамматикам, которые не особо нужны.
По итогу после Дурбина ты легче владеешь формулами и тд, но это если дожил до конца.