Size: a a a

2021 March 27

VS

Vladimir Shitov in Science FYI
Mike Sh
Кстати для интереса - назовите мне хотябы одну реально крутую "сухую" (биоинформатическую) разработку (софт/алгоритм/etc) которая вышла из коммерции
AlphaFold, например

Подход описан, по крайней мере
источник

OL

Olga Lebed in Science FYI
W D
ммм... а как это делать? 😅 да, как вы говорите, я заметила, что никакой прямой информации нету - ни дедлайна, когда оплатить, ни как оплачивать, ни как будет происходить вычет tuition fees за счет assistantship-a... и что за летнее финансирование?.. я впервые слышу о таком
Я бы спросила студентов которые там учатся если есть возможность - обычно они понимают и отвечают на вопросы

Везде все по-разному и не все программы гарантируют финансирование летом
источник

WD

W D in Science FYI
Olga Lebed
Я бы спросила студентов которые там учатся если есть возможность - обычно они понимают и отвечают на вопросы

Везде все по-разному и не все программы гарантируют финансирование летом
спасибо большое! 😊
источник

MS

Mike Sh in Science FYI
Vladimir Shitov
AlphaFold, например

Подход описан, по крайней мере
хах, это чистый хайп. никто им всерьез пользоваться естессно не будет)) ну кроме гугла. для фолдинга куча методов давно написаны и народ будет предпочитать их
источник

VS

Vladimir Shitov in Science FYI
Не соглашусь, видел пример использования подхода, вдохновлённого AlphaFold, в практике
источник

OL

Olga Lebed in Science FYI
W D
спасибо большое! 😊
Можете ещё в international office написать с вопросами
Им обычно вообще не надо проблем с человеком который не знает что делать в чужой стране
источник

MS

Mike Sh in Science FYI
Vladimir Shitov
Не соглашусь, видел пример использования подхода, вдохновлённого AlphaFold, в практике
alphafold это просто нейронка, наложенная на что-то вроде https://www.pnas.org/content/112/44/13567, причем наложенная видимо изза того, что в гугл ai lab есть слово "ai" ))
источник

WD

W D in Science FYI
Olga Lebed
Можете ещё в international office написать с вопросами
Им обычно вообще не надо проблем с человеком который не знает что делать в чужой стране
это вы к тому, что они нормально ответят?
источник

VS

Vladimir Shitov in Science FYI
Ну так про любой софт/алгоритм/etc можно сказать. Всё ведь на чём-то основано
источник

OL

Olga Lebed in Science FYI
W D
это вы к тому, что они нормально ответят?
Надеюсь)
источник

MS

Mike Sh in Science FYI
Vladimir Shitov
Ну так про любой софт/алгоритм/etc можно сказать. Всё ведь на чём-то основано
мой вопрос касался софта, который активно используется коммьюнити. Скажем blast, bwa-mem и тп
источник

VS

Vladimir Shitov in Science FYI
Критерий Стьюдента :D
источник

VS

Vladimir Shitov in Science FYI
А вообще, Schrödinger toolkit, вроде, коммерческий
источник

MS

Mike Sh in Science FYI
Mike Sh
мой вопрос касался софта, который активно используется коммьюнити. Скажем blast, bwa-mem и тп
на самом деле сам себе отвечу что в принципе софт от 10X genomics вроде cellranger попадает под критерий
источник

SK

Sergey Kolchenko in Science FYI
Ну он написан был под их же мокрую технологию
источник

Jelena Čuklina in Science FYI
German
Пока не доказано не важно что сказано, пока контракт не подписан можно отыгрывать назад, будет выглядеть отстойно но што уш тут сделаеш
Даже когда контракт подписан, можно откатить назад. У меня была такая ситуация, прошла интервью с целью «ну познакомлюсь, Нетворк никому ещё не вредил», очень расслабленно, честно спрашивала все скользкие вопросы что смогла придумать, и опытные люди убедили меня, что никакие пацанские договоренности не стоят места с лучшими перспективами и лучшей зарплатой. То место, где я уже подписала, отнеслось неожиданно философски. Отказала я за 3 дня до начала работы. Так что продолжайте интервью. Сорян за некропостинг
источник

MS

Mike Sh in Science FYI
Он опен сурсный и по факту подходит под похожие библиотеки амипликонов (иными словами им можно не только ихние данные обрабатывать но и похожие штуки с UMI)
источник

VS

Vladimir Shitov in Science FYI
Mike Sh
на самом деле сам себе отвечу что в принципе софт от 10X genomics вроде cellranger попадает под критерий
Многие библиотеки поддерживаются компаниями (numpy, например). Да и в целом скорее из индустрии, чем из науки
источник

MS

Mike Sh in Science FYI
Vladimir Shitov
Многие библиотеки поддерживаются компаниями (numpy, например). Да и в целом скорее из индустрии, чем из науки
я про биологию и биоинформатику конечно) если говорить в более общем смысле то естессно RStudio делает RStudio, код мы пишем в VScode или продуктах от JetBrains, и библиотеки крутые поддерживает коммерция
источник

VS

Vladimir Shitov in Science FYI
А ещё можно Bell labs вспомнить  и гору софта от них, включая языки программирования и ОС
источник