Size: a a a

2020 November 17

Jelena Čuklina in Science FYI
Anastasia Pivnyuk
Но чем R правда хорош, так это биологическими библиотеками и всем таким. Если захочется въехать, то я недавно вот такую крутую вещь нашла, как раз по этим делам - https://compgenomr.github.io/book/. Там и по статистике есть блок. А вообще, нам читали очень клёво статистику, так что не могу не поделиться каналом нашего преподавателя - https://www.youtube.com/channel/UCcUnx4Oa6ZwaZj8Q-UHCEzg. Достаточно в сжатые сроки и ориентируется на любой уровень. На выходе по крайней мере ориентируешься, на какие вопросы отвечать при помощи каких методов и какие ограничения
Супер, спасибо!
источник

AP

Anastasia Pivnyuk in Science FYI
Jelena Čuklina
Супер, спасибо!
😊👍🏼
источник

LD

Lavrentii Danilov in Science FYI
Anastasia Pivnyuk
Да. На курсере специализация от Джона Хопкинса есть, по анализу геномных данных, там целый курс посвящен тому, что они демонстрируют статьи, где нет нормального кода, и с которыми впоследствии через много времени были большие скандалы. Включая ситуации, где это например касалось выбора стратегии лечения онкологических больных
Слышал, про него, надо дойти посмотреть))
источник

AP

Anastasia Pivnyuk in Science FYI
Anastasia Pivnyuk
Но чем R правда хорош, так это биологическими библиотеками и всем таким. Если захочется въехать, то я недавно вот такую крутую вещь нашла, как раз по этим делам - https://compgenomr.github.io/book/. Там и по статистике есть блок. А вообще, нам читали очень клёво статистику, так что не могу не поделиться каналом нашего преподавателя - https://www.youtube.com/channel/UCcUnx4Oa6ZwaZj8Q-UHCEzg. Достаточно в сжатые сроки и ориентируется на любой уровень. На выходе по крайней мере ориентируешься, на какие вопросы отвечать при помощи каких методов и какие ограничения
Могу от себя сказать, что я после этого, по крайней мере, знаю где искать и что спрашивать 🙈 А то раньше статьи по статистике на Википедии были набором символов 😂
источник

AP

Anastasia Pivnyuk in Science FYI
Lavrentii Danilov
Слышал, про него, надо дойти посмотреть))
На самом деле, не советую) он очень неравномерный. Есть хорошие курсы, есть просто ужасные. Командную строку плохо читают, биокондуктор тоже хреново
источник

J

JeniaVan in Science FYI
Jelena Čuklina
Может быть, будем записывать подкаст. Локально про это общаемся в баре, чаще в баре при женском чате от ламы-ламы. Ну и на всяких мероприятиях в панельных дискуссиях я из этой истории какие-то советы иногда раздаю, зовите, я пока редко отказываюсь :)
А можно ссылку на женский чятик, плиз
источник

LD

Lavrentii Danilov in Science FYI
Anastasia Pivnyuk
На самом деле, не советую) он очень неравномерный. Есть хорошие курсы, есть просто ужасные. Командную строку плохо читают, биокондуктор тоже хреново
Ну избирательно послушать всегда можно
источник

LD

Lavrentii Danilov in Science FYI
Anastasia Pivnyuk
Но чем R правда хорош, так это биологическими библиотеками и всем таким. Если захочется въехать, то я недавно вот такую крутую вещь нашла, как раз по этим делам - https://compgenomr.github.io/book/. Там и по статистике есть блок. А вообще, нам читали очень клёво статистику, так что не могу не поделиться каналом нашего преподавателя - https://www.youtube.com/channel/UCcUnx4Oa6ZwaZj8Q-UHCEzg. Достаточно в сжатые сроки и ориентируется на любой уровень. На выходе по крайней мере ориентируешься, на какие вопросы отвечать при помощи каких методов и какие ограничения
Огонь! Ну и присоединюсь, что всякая диффэкспресиия и прочее это только R и никакой не питон...
источник

AP

Anastasia Pivnyuk in Science FYI
Lavrentii Danilov
Огонь! Ну и присоединюсь, что всякая диффэкспресиия и прочее это только R и никакой не питон...
Это, конечно, правда. Как и вообще любой именно биологический анализ... общематематические/статистические/относящиеся к машинному обучению вещи  это, на мой взгляд, все-таки питон. Но все что худо-бедно специальное биологическое - только R. Почему-то до сих пор не могут нормально биокондуктор для питона адаптировать 😔 Считаю это дискриминацией и принуждением по отношению к питонистам! 😅
источник

AP

Anastasia Pivnyuk in Science FYI
Может, кто-то знает, почему биокондуктор для питона не сделали?
источник

LD

Lavrentii Danilov in Science FYI
Ну.. можно вроде на стажировку в биокондактр и уговорить их это сделать))))
источник

DP

Dmitry Penzar in Science FYI
Anastasia Pivnyuk
Но чем R правда хорош, так это биологическими библиотеками и всем таким. Если захочется въехать, то я недавно вот такую крутую вещь нашла, как раз по этим делам - https://compgenomr.github.io/book/. Там и по статистике есть блок. А вообще, нам читали очень клёво статистику, так что не могу не поделиться каналом нашего преподавателя - https://www.youtube.com/channel/UCcUnx4Oa6ZwaZj8Q-UHCEzg. Достаточно в сжатые сроки и ориентируется на любой уровень. На выходе по крайней мере ориентируешься, на какие вопросы отвечать при помощи каких методов и какие ограничения
Спасибо. Хотел почитать как раз про геномы.

Насчет статистики и машинки - мне нравится statquest, он очень старается и быстро правит ощибки, если указать.

О, а ссылка-то на Дмитрия Давидовича)) и на русском читает даже)
источник

AP

Anastasia Pivnyuk in Science FYI
Dmitry Penzar
Спасибо. Хотел почитать как раз про геномы.

Насчет статистики и машинки - мне нравится statquest, он очень старается и быстро правит ощибки, если указать.

О, а ссылка-то на Дмитрия Давидовича)) и на русском читает даже)
Статквест - это любовь!
источник

К

Кирилл in Science FYI
Ребят привет. Кто нибудь в курсе как сделать heatmap с дендрограммой на основе генов и типов мутаций в них
источник

DP

Dmitry Penzar in Science FYI
Anastasia Pivnyuk
Но чем R правда хорош, так это биологическими библиотеками и всем таким. Если захочется въехать, то я недавно вот такую крутую вещь нашла, как раз по этим делам - https://compgenomr.github.io/book/. Там и по статистике есть блок. А вообще, нам читали очень клёво статистику, так что не могу не поделиться каналом нашего преподавателя - https://www.youtube.com/channel/UCcUnx4Oa6ZwaZj8Q-UHCEzg. Достаточно в сжатые сроки и ориентируется на любой уровень. На выходе по крайней мере ориентируешься, на какие вопросы отвечать при помощи каких методов и какие ограничения
@awniar вот тут рабочая ссылка на курс от Дмитрия Давидовича) ура, я думал, он его потер с просторов сети.
источник

AP

Anastasia Pivnyuk in Science FYI
Dmitry Penzar
Спасибо. Хотел почитать как раз про геномы.

Насчет статистики и машинки - мне нравится statquest, он очень старается и быстро правит ощибки, если указать.

О, а ссылка-то на Дмитрия Давидовича)) и на русском читает даже)
Да, он просто огонь) Мне кажется, что он удивительно сумел справиться с задачей - обьяснить статистику людям, предположительно вообще не знающим линал и матан, но при этом не пожертвовав тонкостями. То есть для меня это прям супер праймер был, после этого любые курсы по статистике нормально шли
источник

AZ

Arthur Zalevsky in Science FYI
Dmitry Penzar
@awniar вот тут рабочая ссылка на курс от Дмитрия Давидовича) ура, я думал, он его потер с просторов сети.
пора делать бэкапы)
источник

ИК

Иван Котомин... in Science FYI
Dmitry Penzar
@awniar вот тут рабочая ссылка на курс от Дмитрия Давидовича) ура, я думал, он его потер с просторов сети.
Дагдеж столько времени то взять на все!!!
источник

SK

Sergey Kolchenko in Science FYI
Иван Котомин
Дагдеж столько времени то взять на все!!!
Не сидеть в телеге))00
источник

SV

Semen Vasilev in Science FYI
Sergey Kolchenko
Не сидеть в телеге))00
А откуда тогда про все это узнавать, что оно есть?:)
источник