Size: a a a

2020 May 30

п

просто так взять... in Science FYI
Semen Vasilev
да вроде да. но небольшой червь сомнения грызет меня))  я тоже больше склоняюсь к мысли, что давления\объема не хватает. но с тервером можно посчитать вероятность попадания частицы в любой канал на выходе. если считаем, что на каждой развилке вероятность 1\2, что кстати не так из-за (скорее всего) нестационарного и не ламинарного потока (частицы слишком большие относительно диаметра канала). но даже если 1\2 - составляем уравнение и считаем. в тервере иногда бывают очень не тривиальные ответы)))  например, какая вероятность, что в классе с боле чем 24 учениками будут люди рожденные в один день?
Да, понимаю, тервер коварен. Но тут поток каждый раз просто делится пополам. Вероятность 1/2 у нас из доски Гальтона, которая как модель не подходит еще и по конфигурации каналов.

Так, кажется, есть идея. Если частицы двигаются преимущественно по центру широкого канала, то развилку они могут проходить ближе к внутренним стенкам (не отскакивать и перемешиваться, а плавно обтекать) и в следующих развилках оказываться ближе к продольной оси чипа.

@LiraRiko такое может быть?
источник

DP

Dmitry Penzar in Science FYI
источник

КЕ

Кирилл Ермин... in Science FYI
recursive self model
Добрый! Коллабы делали тотальный масс-спек нашего объекта, но не увидели в результатах белков ЭТЦ (а мы занимаемся митогеномикой этого объекта). Я задумался вот, почему так могло произойти, сам не особенно представляю, как устроен протокол МС ) То есть проблема может быть в пробоподготовке, спасибо!
Объект стандартный? Т.е. спектры его белков в базах данных представлены?
источник

M

MT in Science FYI
Постойте, это же другой фильм
источник

A

Alex in Science FYI
ну да, сейчас все будут на обезьян валить. Совершенно же ясно, что они чипированы и управляются извне...
источник

r

recursive self model in Science FYI
Кирилл Ермин
Объект стандартный? Т.е. спектры его белков в базах данных представлены?
Не модельный, есть только аннотированные геном+транскриптом, протеома нет (МС коллабораторов сделан для близкого рода, но в первом сообщении я решил не усложнять)
источник

DP

Dmitry Penzar in Science FYI
Alex
ну да, сейчас все будут на обезьян валить. Совершенно же ясно, что они чипированы и управляются извне...
Почемы ви таки исключаете возможность тщательно спланированного ими восстания
источник

A

Alex in Science FYI
Dmitry Penzar
Почемы ви таки исключаете возможность тщательно спланированного ими восстания
каждое восстание подчинено всемирному правительству. Больше мне нечего сказать
источник

КЕ

Кирилл Ермин... in Science FYI
recursive self model
Не модельный, есть только аннотированные геном+транскриптом, протеома нет (МС коллабораторов сделан для близкого рода, но в первом сообщении я решил не усложнять)
Я не понял. У коллабораторов есть масс-спектры целевых белков от рода того же семейства?
Как понять "МС сделан для близкого рода"?

В любом случае, если это млекопитающее, не думаю, что спектры митохондриальных переносчиков будут настолько своебразными, тем более если множество цитоплазматических белков, наверно, не только самых консервативных, определили без проблем.
источник

r

recursive self model in Science FYI
Кирилл Ермин
Я не понял. У коллабораторов есть масс-спектры целевых белков от рода того же семейства?
Как понять "МС сделан для близкого рода"?

В любом случае, если это млекопитающее, не думаю, что спектры митохондриальных переносчиков будут настолько своебразными, тем более если множество цитоплазматических белков, наверно, не только самых консервативных, определили без проблем.
На первый вопрос, "да", но в этих спектрах не обнаружено белков ЭТЦ. Не, не млекопитающие. Простейшие
источник

КЕ

Кирилл Ермин... in Science FYI
recursive self model
На первый вопрос, "да", но в этих спектрах не обнаружено белков ЭТЦ. Не, не млекопитающие. Простейшие
Я не специалист в протеомике, но, думаю, в таком случае стоит попытаться выделить искомый белок в чистом виде и определить его характерный масс-спектр.

Возможно, есть софт, который позволяет смоделировать масс-спектр белка по структуре, но подсказать не могу.
источник

AZ

Arthur Zalevsky in Science FYI
recursive self model
Добрый! Коллабы делали тотальный масс-спек нашего объекта, но не увидели в результатах белков ЭТЦ (а мы занимаемся митогеномикой этого объекта). Я задумался вот, почему так могло произойти, сам не особенно представляю, как устроен протокол МС ) То есть проблема может быть в пробоподготовке, спасибо!
мб @ilgisonis или @olka_vv смогут подсказать
источник

КЕ

Кирилл Ермин... in Science FYI
В любом случае, коллабораторы, которые взялись за такую задачу, должны ориентироваться в вопросе. Это же не случайные люди.
Поэтому все же склонен думать, что проблема с потерей белка на этапе пробоподготовки или култивирования образца.
@mitryaf, микроскопию делали? Чисто визуально - митохондрии хорошо представлены?
источник

IS

Ibrahim Salamov in Science FYI
Привет, чат. Подскажите, где искать международные исследования. Например, по эпилепсии, по хирургии эпилепсии.

Как вы вообще это делаете? Просто читаете очень много статей? Есть сервисы, где возможно сразу выпадает список по запросу ?
источник

хд

хранитель древних фо... in Science FYI
Ibrahim Salamov
Привет, чат. Подскажите, где искать международные исследования. Например, по эпилепсии, по хирургии эпилепсии.

Как вы вообще это делаете? Просто читаете очень много статей? Есть сервисы, где возможно сразу выпадает список по запросу ?
Самый простой ответ гугл по ключевым словам и знаками типа +, "". Из гугла поиска можно пойти в гугл сколар и посмотреть кто цитирует эту работу. И постепенно так набирается

В пабмед еще есть расширенный поиск: по ключевым словам, сочетанию и также где именно поиск (абстракт, весь текст, ключевые слова)
источник

AZ

Arthur Zalevsky in Science FYI
Ibrahim Salamov
Привет, чат. Подскажите, где искать международные исследования. Например, по эпилепсии, по хирургии эпилепсии.

Как вы вообще это делаете? Просто читаете очень много статей? Есть сервисы, где возможно сразу выпадает список по запросу ?
пабмед + mesh terms
источник

хд

хранитель древних фо... in Science FYI
Arthur Zalevsky
пабмед + mesh terms
Точно
источник

А

Антон in Science FYI
Минобрнауки разрешило ученым вернуться в лаборатории и отправиться в экспедиции

Летом ученые смогут возобновить исследовательскую деятельность: работу со спецоборудованием и биологическими коллекциями, проведение морских и прочих экспедиций. Главное условие — руководители образовательных организаций должны позаботиться о профилактике распространения COVID-19.

Занятия в вузах и итоговая аттестация до окончания режима самоизоляции будут проходить в дистанционной форме, как и приемная кампания.

Приказ Министерства образования и науки вступает в силу с 1 июня.
источник

А

Антон in Science FYI
Получается выходим, ну, те кто делает эксперимент
источник

AZ

Arthur Zalevsky in Science FYI
кстати, @x_plaguedoctor_x  мы же хотели для вас такой видос записать)
источник