Size: a a a

2019 August 19

O

Orodret in Science FYI
Alex Beliavskaia
Поменяли несколько ферментов в 1д, обновили минноу и бейсколлер.
Ага. Только с р10 своя специфика. И количество фермонтов плавает. А нужно под заказ все точно подобрать
источник

AB

Alex Beliavskaia in Science FYI
В каком смысле плавает?
источник

O

Orodret in Science FYI
Arthur Zalevsky
ну там не степень, а целиком весь кусок с описанием) копипста наверное. думаю еще поправят.
Да, не знал, как это назвать ;))
источник

O

Orodret in Science FYI
Alex Beliavskaia
В каком смысле плавает?
Они их количество меняют. Плюс меняют, на каком шаге какие ферменты используют. А с теми же баркодами это может быть критично.  Там на одну ячейку фасовка уходит
источник

AB

Alex Beliavskaia in Science FYI
А, ну такие да. Но если ты уже в теме, то разобраться с этим легко, принципиально не меняют уже давно ничего.
источник

O

Orodret in Science FYI
Это да. Но держит в тонусе)) я уже так ошибся в расчетах, когда считал под лск108, а они как раз обновились и прислали 109
источник

AB

Alex Beliavskaia in Science FYI
Orodret
Это да. Но держит в тонусе)) я уже так ошибся в расчетах, когда считал под лск108, а они как раз обновились и прислали 109
Именно после обновления с 108 до 109 я стала заранее проверять обновления! =D
источник

🚑

🚑🚑🚑 in Science FYI
Привет
источник

O

Orodret in Science FYI
Alex Beliavskaia
Именно после обновления с 108 до 109 я стала заранее проверять обновления! =D
Во-во)) кста, sre кит случаем не пробовали?
источник

O

Orodret in Science FYI
Alex Beliavskaia
Именно после обновления с 108 до 109 я стала заранее проверять обновления! =D
И видела про человеческую хромосому? Раз уж про нанопору речь зашла))
источник

AB

Alex Beliavskaia in Science FYI
Что такое сре кит? Ага, видела)
источник

O

Orodret in Science FYI
Alex Beliavskaia
Что такое сре кит? Ага, видела)
У циркуломикс вышел. Очистка днк от коротких фрагментов. Вроде должна н50 от 8к давать. Скоро у нас будут тестить
источник

AB

Alex Beliavskaia in Science FYI
Хммм. Я не заморачиваюсь на сайз селекшн, у меня простым 1д больше десятки n50 стабильно. И часто нет достаточно ДНК, чтобы заниматься сайз-селектом)
источник

AB

Alex Beliavskaia in Science FYI
Ты кстати видел, я в фб хвасталась, что два раза запускала библиотеку с мизером ДНК? Один раз получила 10 гигабаз с 50 нг загруженной библиотеки, а второй раз мне нужен был маленький бактериальный геном, но начинала я вообще с 80 нг, сколько в итоге загрузила, кажется, даже не меряла, чтобы ДНК не терять. Сняла 2.5 в итоге :)
источник

SK

Sofya Kasatskaya in Science FYI
Hidden 🐈 Markov 🐈 Model
прошу, посоветуйте что-то на тему  Immunology Informatics / Computational Immunology для человек из бекграунда информатики и компьютерных наук
Советую начать с нескольких молбио курсов на степике, потом иммунология например по kuby's Immunology, потом можно подобрать релевантные статьи-обзоры по теме за последние годы
источник

А

Алиса in Science FYI
кто-нибудь делал отрицательный контроль gRNA? как вы проверяли, что вашей последовательности точно нигде нет в геноме?
источник

H🐈

Hidden 🐈 Markov 🐈 Mo... in Science FYI
Sofya Kasatskaya
Советую начать с нескольких молбио курсов на степике, потом иммунология например по kuby's Immunology, потом можно подобрать релевантные статьи-обзоры по теме за последние годы
понятно, благодарю
источник

O

Orodret in Science FYI
Alex Beliavskaia
Хммм. Я не заморачиваюсь на сайз селекшн, у меня простым 1д больше десятки n50 стабильно. И часто нет достаточно ДНК, чтобы заниматься сайз-селектом)
Там вроде идея именно в том, что от 8к, а так должно около 40к быть. Но десятка это классно! Единственное злит, что очень от объекта зависит
источник

KK

Konrad Kurse in Science FYI
Здравствуйте, с 26 августа начинаю учиться в Южно-Калифорнийском университете, и не знаю что выбрать, рассматриваю два варианта по double Major  
BS in Business Administration and BS in Applied and computational math или BS Economics and Mathematics. Не подскажите что выбрать лучше?
источник

S

Sasha in Science FYI
Алиса
кто-нибудь делал отрицательный контроль gRNA? как вы проверяли, что вашей последовательности точно нигде нет в геноме?
Пробластить просто.

Если для человека или мыши, то тут уже куча надизайнена: https://www.genscript.com/CRISPR-gRNA-library.html
источник