И получается, что это всё ещё латиница, но в ней можно использовать то, что используют в кириллице.
Можно. Но надо извращаться. А зачем этот цирк с переводом на латиницу вообще?
The Czech alphabet uses several letters in addition to the 26 letters used in the English alphabet. These are á, č, ď, é, ě, í, ň, ó, ř, š, ť, ú, ů, ý, ž.