Привет уязвимости, чистки от не до конца удалившегося софта, ручное обновление всего на некоторых дистрах или собранного из исходников, фрагментация в ехт4 всё равно есть
Фрагментация в ext4 хоть и есть, но она минимальна и, как правило замечается когда диск засран подзавязку.
На каких распространённых дистрах тебе каждую программу нужно отдельно обновлять?
Уязвимости, как показывает практика, закрываются довольно быстро, а вот те же вирусы - отдельная тема. Линукс так построен, что довольно большая часть ПО находится в репозиториях, когда в винде ты скачиваешь с левых сайтов. Это довольно большая проблема. Да, майкасофты пытаются что-то запустить в духе своего магазина приложений, но что-то им как-то никто и не пользуется. Почему? Понятия не имею, ибо его не застал.
Вот чистки софта не до конца - это да, тут согласен. Грешная проблема