Может всё же стоит выяснить в банке, как производится частичное досрочное погашение?
У адекватных банков эта инфа есть на сайте.
Если погашение идёт только в заранее заданный день, имеет смысл держать сумму на другом счёте, где капают проценты, перечислять на счёт погашения в день платежа и делать частичное погашение.
Если частичное погашение основной суммы производится в произвольный день, вносить его сразу, как появились свободные деньги.
Если частичное погашение производится в день внесения и уходит на проценты, собирать сумму, большую суммы процентов на текущий день и вносить сразу по достижении этого.
И так далее. Нюансов там немало.