У них точки соприкосновения только работа с линейной памятью и в будующем сборщик мусора, в остальном это совсем разные vm. Более того у wasm-а аж два компилятора - один baseline и больше похож на интерпретатор, другой - с jit-компиляцией
При релизе этой штуки в хроме (liftoff) наш код бомбанул с падением браузера. Плясали с бубном, помогло отключение генерации кода обработки исключений. Оно нам не надо было, поэтому отключили и забили.