F
Первопричина этого состоит в том, что всякий GIF объёмом меньше десятка мегабайтов автоматически преобразуется (с внесением потерь) в видеопоток AVC внутри контейнера MP4 (чтобы анимация меньше занимала и быстрее доходила), а то и другое прозрачность не предусматривает. Началось это 4½ года тому назад — в январе 2016 года.
Но и GIF болѣе чѣмъ десятимегабайтовый, по-видимому, не может надеяться на прозрачность.
Необязательно если гифка отправляется как стикер отправлять ее в .gif, можно и свой формат придумать после точки, хотя по сути контейнер остаётся тот же гиф, но так как после точки переименованно он не будет отправлять как файл или как мпег или что там, это как вебп файлы при отправке не более 512*512рх как стикеры, так и гифки можно, при тех же размерах и при наличии альфа канала постить как стикеры