Можно почистить образец, померить концентрацию и прогнать немного на форезе, чтобы оценить длину
Но это если порез уж очень сильный
Если не искромсали, не переживайте
Как лайфхак почищенную из геля пробу можно поставить на ПЦР как матрицу на 17 циклов - умножит ДНК и успокоит вас во много раз(если нужно)