Size: a a a

2021 February 02

AC

Alexander C in Science FYI
Переслано от Alexander C
источник

OK

Olga Kalinina in Science FYI
Ну и чудно
источник

R

Ruz in Science FYI
гм, вакцин от астразенеки и прочих, действительно не хватает, но почему в francetvinfo решили, что Спутника хватит?
какая-то нелогичность во всем 😂
источник

A

Aleshka in Science FYI
Ruz
гм, вакцин от астразенеки и прочих, действительно не хватает, но почему в francetvinfo решили, что Спутника хватит?
какая-то нелогичность во всем 😂
Больше не меньше)
источник

R

Ruz in Science FYI
Aleshka
Больше не меньше)
ну не знаю, должно быть какое-то “планирование”, а здесь им и не пахнет
Еще любопытно, не редуцируют ли вакцины до одношотной из-за проблем с производством, что тогда будет с эффективностью (так у jj 66%).
Хотелось бы на самом деле, какой-нибудь новавакс.

Еще интересно, что там с вариантами, особенно с южноафриканским.
источник

AP

Alexander Predeus in Science FYI
Ruz
ну не знаю, должно быть какое-то “планирование”, а здесь им и не пахнет
Еще любопытно, не редуцируют ли вакцины до одношотной из-за проблем с производством, что тогда будет с эффективностью (так у jj 66%).
Хотелось бы на самом деле, какой-нибудь новавакс.

Еще интересно, что там с вариантами, особенно с южноафриканским.
про южноафриканский все забудут, когда будет много вакцинированных
если они будут тусить рядом с больными, это идеальные условия для отбора - большой размер популяции (вируса) и большое давление отбора (иммунитет)
так что я надеюсь на гос уровне уже готовы карантинить влетающих и тд
источник

R

Ruz in Science FYI
Alexander Predeus
про южноафриканский все забудут, когда будет много вакцинированных
если они будут тусить рядом с больными, это идеальные условия для отбора - большой размер популяции (вируса) и большое давление отбора (иммунитет)
так что я надеюсь на гос уровне уже готовы карантинить влетающих и тд
Я про эффективность вакцин против вариантов (в частности спутника), интересуюсь =)
Карантинить было бы неплохо, конечно. Как вообще все так сложилось ужасно, никак не пойму.
источник

R

Ruz in Science FYI
Котик Обормотик
Кто-то уже смотрел выпущенный сейчас отчёт о результатах третьей фазы испытаний спутника ?
На медузе вышел текст про публикацию результатов фазы III от Ильи Ясного, вроде серьезных проблем не нашлось https://meduza.io/feature/2021/02/02/nakonets-to-sozdateli-sputnika-v-opublikovali-rezultaty-issledovaniya-etoy-vaktsiny-glavnyy-ona-bezopasna-i-ochen-effektivna-no-voprosy-ostalis + есть комменты на фсбуке https://www.facebook.com/ilia.yasny/posts/3838219356201114
источник

ИК

Иван Котомин... in Science FYI
Alexander Predeus
про южноафриканский все забудут, когда будет много вакцинированных
если они будут тусить рядом с больными, это идеальные условия для отбора - большой размер популяции (вируса) и большое давление отбора (иммунитет)
так что я надеюсь на гос уровне уже готовы карантинить влетающих и тд
Не очень понял фразу. Будут идеальные условия, чтобы юар-штамм стал доминирующим?
источник

КО

Котик Обормотик... in Science FYI
Ruz
На медузе вышел текст про публикацию результатов фазы III от Ильи Ясного, вроде серьезных проблем не нашлось https://meduza.io/feature/2021/02/02/nakonets-to-sozdateli-sputnika-v-opublikovali-rezultaty-issledovaniya-etoy-vaktsiny-glavnyy-ona-bezopasna-i-ochen-effektivna-no-voprosy-ostalis + есть комменты на фсбуке https://www.facebook.com/ilia.yasny/posts/3838219356201114
Да, я пошла в ланцете обзор читать
источник

ДИ

Денис Исаев... in Science FYI
Котик Обормотик
Да, я пошла в ланцете обзор читать
Можно потом ревью краткое, пожалуйста?
источник

AC

Alexander C in Science FYI
C разрешения Ольги Матвеевой публикуем выжимку её аналитики по вакцине ЭпиВакКорона от ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» Роспотребнадзора.

1️⃣В Роспотребнадзоре заявили о 100%-ной иммунологической эффективности "Эпиваккороны". А почему не 200%? Имеется в виду эффективность провоцирования иммунного ответа, но не защиты добровольцев от заболевания. Однако и с иммунным ответом полная непрозрачность, про него не известно самого главного: являются ли антитела протективными и появляется ли Т-клеточный ответ. Нет там вообще не сравнивали заражение. Утверждение основано на анализе антител (пост Ольги в ФБ)

2️⃣ЭпиВакКорона антител - либо нет, либо титр очень маленький. Я сделала сравнение между уровнем антител к шиповидному белку, который развивается у вакцинированных Спутником и ЭпиВакКороной. Прицепляю картинку. На картинке видно, что после вакцинации Спутником титр антител у испытуемых в интервале от 1600 до 50000, в то время как у про вакцинированных ЭпиВакКороной он колеблется от нуля до 200. Данные по Спутнику я взяла из публикации в Ланцете, а данные по ЭпиВакКороне мне прислали от самоорганизовавшейся группы участников испытаний, которые сами решили сдать анализ на антитела. Добровольцы - участники испытаний, объединились в группу (группа в телеграмме @epivakorona). В этой группе четверть испытуемых должна была получить плацебо. Какие-то нули в этой группе ожидаемы. Однако в независимости от плацебников можно видеть, что общий уровень антител не сравнится с уровнем провакцинированных Спутником. Все анализы антител сделаны системой рекомендованной Вектором для такого анализа (пост Ольги в ФБ c графиками и ссылками)

3️⃣Сделать разметку на последовательности шиповидного белка так чтобы увидеть пептиды из патента ЭпиВакКороны и пептиды, которые в эксперименте провоцируют у людей выработку нейтрализующих антител придумала Маргарита [Романенко]. Вот патент

Я повторила работу Маргариты и вот, что получилось. На картинке видно, что пептидные иммуно-доминантные эпитопы, которые у большинства людей видит иммунная система (покрашены зелёным и голубым), расположены в других местах белка и не перекрываются ни с одним из пептидов, которые использует или может использовать в своей вакцине Вектор (покрашены красным).

Увы, но шанс, что вакцина не провоцирует образование нейтрализующих антител, а провоцирует антитела направленные на His Tag химерного рекомбинантного белка не маленький. Этим можно было бы объяснить почему антитела (якобы на шиповидный белок) видят только некоторые коммерческие системы, а другие не видят. В тех системах, которые "видят" антитела в белке на подложке присутствует His Tag. Такую гипотезу тоже высказала Маргарита. А вот статьи в которых картировали пептиды.

(пост Ольги в ФБ с рисунками и ссылками)

4️⃣В начале декабря были опубликованы эти ответы Вектора на вопросы по ЭпиВакКороне. 
У меня есть свои вопросы и комментарий.

Сказано представителем Вектора: “В рамках клинических исследований фазы I-II, начатых в июле 2020 года, индукция специфических антител произошла у 100 % добровольцев“ Мой вопрос:
“были ли среди этих антител нейтрализующие и/или протективные?”

Сказано представителем Вектора: “Критериями оценки эффективности являлась доля добровольцев с повышением уровня иммунного ответа в виде средних геометрических титров специфических антител в иммуноферментном анализе более чем в ≥ 4 раза через 21 день после второй вакцинации и 90, 180 и 270 дней после первой вакцинации по сравнению с плацебо.” Мой вопрос все тот же: 
“были ли какие то антитела из обнаруженных протективными?”

Сказано представителем Вектора: “Таким образом исследования безопасности и эффективности вакцины «ЭпиВакКорона» будут продолжены при проведении III-IV фазы клинических исследований.” Комментарий: 
С декабря уже началась массовая вакцинация этой вакциной. Мы так и не знаем ничего, ни про наличие протективных антител, ни про способность вакцины защищать от инфекции. Вместо 100% эффективности мы имеем 100% непрозрачность.
(пост Ольги в ФБ)
источник
2021 February 03

AP

Alexander Predeus in Science FYI
Иван Котомин
Не очень понял фразу. Будут идеальные условия, чтобы юар-штамм стал доминирующим?
идеальные условия для получения штаммов которые не будут блокироваться вакциной
источник

ИК

Иван Котомин... in Science FYI
Alexander Predeus
идеальные условия для получения штаммов которые не будут блокироваться вакциной
Ага, так и понял, спс
источник

DA

Dmitry A in Science FYI
Ruz
На медузе вышел текст про публикацию результатов фазы III от Ильи Ясного, вроде серьезных проблем не нашлось https://meduza.io/feature/2021/02/02/nakonets-to-sozdateli-sputnika-v-opublikovali-rezultaty-issledovaniya-etoy-vaktsiny-glavnyy-ona-bezopasna-i-ochen-effektivna-no-voprosy-ostalis + есть комменты на фсбуке https://www.facebook.com/ilia.yasny/posts/3838219356201114
А почему они по 21 дню от первой инъекции считают эффективность понятно? Так и было в изначальном протоколе?
Просто у них и по 28 дню в статье есть данные, они несущественно но хуже.
источник

O

Orodret in Science FYI
Alexander Predeus
идеальные условия для получения штаммов которые не будут блокироваться вакциной
Они ведь и так будут, пока провакцинирована часть? Или всех будут держать на карантине до 100% покрытия? И вроде как вакцины создавались, чтобы снимать ограничения, а так все равно карантин будет
источник

Jelena Čuklina in Science FYI
Orodret
Они ведь и так будут, пока провакцинирована часть? Или всех будут держать на карантине до 100% покрытия? И вроде как вакцины создавались, чтобы снимать ограничения, а так все равно карантин будет
Похоже, что много где будут ждать результатов из Израиля - насколько эффективно блокируется передача, и строить модели типа той что у Imperial была. Но так как по ещё старым моделям устойчивое падение ожидают при иммунитете у 60-70%, а крупные поставки вакцин ожидают к середине весны в лучшем случае, то раньше июля-августа основные ограничения не снимут, и если их снимут к следующей зиме - то это успех. А там и по второму кругу вакцинировать надо будет, видимо.
источник

M

Marina Afanasyeva in Science FYI
Нужен совет! Если я выделяю короткий пцр продукт из геля >2% с пом. Thermo Gel Extraction Kit, я должна растворять гель в 2 раза большем кол-ве binding buffer (2 объема геля). Поскольку фрагмент короткий, нужно еще добавить изопропанол, 1 объем геля. Но если у меня было 2хбуфера, то и изопропанола надо больше? А сколько именно?
источник

O

Orodret in Science FYI
Jelena Čuklina
Похоже, что много где будут ждать результатов из Израиля - насколько эффективно блокируется передача, и строить модели типа той что у Imperial была. Но так как по ещё старым моделям устойчивое падение ожидают при иммунитете у 60-70%, а крупные поставки вакцин ожидают к середине весны в лучшем случае, то раньше июля-августа основные ограничения не снимут, и если их снимут к следующей зиме - то это успех. А там и по второму кругу вакцинировать надо будет, видимо.
А насколько такая модель учитывает то, что вирус будет меняться? Оо
источник

Jelena Čuklina in Science FYI
Orodret
А насколько такая модель учитывает то, что вирус будет меняться? Оо
Это можно зашивать в разные R-числа. Не должно быть так уж принципиально сложно. Собственно, в Швейцарии региональные R-числа - это часть критерия когда что кому можно открывать, и его прогноз заметно ухудшился с приходом британского штамма.
источник