Классная работа

Zamanian et al. reported that two types of reactive astrocytes, termed“A1”and“A2,” were purified and genetically profiled from mice in the models of neuroinflammation and ischemia, respectively (Zamanian et al. 2012).
Moreover, the gene transcriptome analyses of these two types of reactive astrocytes show that they may play different roles in CNS. A1 neuroinflammatory reactive astrocytes upregulate the genes that have been previously shown to be destructive to synapses, while ischemia-induced A2 reactive astrocytes promote survival and growth of neurons and synapse repair by upregulating a lot of neurotrophic factors and thrombospondins (Zamanian et al. 2012).

Привет. Есть дурацкий вопрос по samtools, гугл почему-то не помогает :) При попытке сделать индекс для файла он выдает ошибку :
[E::hts_idx_push] Unsorted positions on sequence #19477: 185 followed by 71 . Пересортировка не помогает. Чек качества quickchek и flagstat никаких проблем не находят.
Вдруг кто-то сталкивался с такой проблемой и понимает, как ее решать?

Может быть, сортировка не по тому полю идёт? Он, похоже, просит по позиции, а там может быть отсортировано по названию

?

Я думал, что активированные нейровоспалением астроциты по типу те же самые, что и астроциты, из которых возникает шрам при ишемии

спасибо!

Привет! Может быть, кто-то знает, где в Москве делают быстрые пцрные тесты на ковид (в том числе платно, нужно как можно быстрее получить результаты)?

Я слышала, что в Шереметьево можно сделать

о, спасибо

Инвитро, Гемотест и подобные тоже не долго

Мобилмед 2 дня

В похожей ситуации нахожусь, подписалась. Многие вещи будут полезны, спасибо

Репост из ОДС
"Ищу аспиранта на вот этот проект на 3 года: https://www.upf.edu/web/disc4all/recruitment.
Страна
Финляндия
Университет
University of Oulu
Supervisors
Prof. Simo Saarakkala, PhD
Prof. Jaro Karppinen, MD, PhD
Dr. Aleksei Tiulpin, PhD
Descrption of the position
The recruited PhD student will focus on developing machine learning based prediction and severity assessment models for intervertebral disc (IVD) degeneration. The primary aim will be to combine radiomic features from magnetic resonance (MR) and X-ray images, omics data, and other background data of the patients – in order to discover multiple phenotypes of the IVD degenerative disease. In this project, we will leverage patient material from TwinsUK and Northern Finland Birth Cohort datasets.
Salary
3950€ gross (approx. 2900-3000€ net).
О группе и проекте по русски
Наша группа самая передовая по Medical AI в :flag-fi: . Мы публикуемся в IEEE TMI, PNAS, Radiology, Scientific Reports, Osteoarthritis and Cartilage etc. Весь рисерч делается с клиническим уклоном, поэтому на конфы типа CVPR  etc мы не работаем. Однако, все возможно при желании. На конкретно этой позиции мы предлагаем отличный network (UK, Spain, Finland), ну и зарплату выше чем у постдока. Ожидаем получить замотивированного кандидата, который не только умеет делать git clone, но еще и имеет vision, а так же хочет делать серьезный клинический research с сота DL методами.
How to apply
https://www.upf.edu/documents/236182816/236664378/ESR4-Vacancies-Disc4All_UOULUv2.pdf/ee654670-6a87-d5c5-a76e-a5d903d19a50
"

жиза

Привет чатик. Есть действующий грант от ESRF (причем продленный), посвященный визуализации опухолей на синхротроне. Реально ли приехать с ним в другую лабу / на PhD и использовать его оттуда уже с другой командой? Такое практикуется? ESRF абсолютно все равно на локацию откуда исследователи.

Есрф вроде не совсем все равно. Вроде как страна резиденттва ученого должна иметь долю в финансировании. И врем распределяется в соотвествии с этими долями. Ну как минимум для обычных заЯвок так рассказывали

ну я рассматриваю европу и те страны, которые участвуют

без экзотики