Телеграмм чат группы sci

коллеги биоинформатики! какой вы знаете лучший способ извлекать наличие/отсутствие и экспрессию РНК от вирусов в образцах РНК-сека человека? тулов разных куча, не знаю за какой браться, поделитесь опытом

источник

16:16пожаловаться #5

MS

Mike Sh in Science FYI

Anton Karelin

коллеги биоинформатики! какой вы знаете лучший способ извлекать наличие/отсутствие и экспрессию РНК от вирусов в образцах РНК-сека человека? тулов разных куча, не знаю за какой браться, поделитесь опытом

https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-018-1403-7 могу такую экспериментальную штуку посоветовать

Genome Biology

ROP: dumpster diving in RNA-sequencing to find the source of 1 trillion reads across diverse adult human tissues

High-throughput RNA-sequencing (RNA-seq) technologies provide an unprecedented opportunity to explore the individual transcriptome. Unmapped reads are a large and often overlooked output of standard RNA-seq analyses. Here, we present Read Origin Protocol (ROP), a tool for discovering the source of all reads originating from complex RNA molecules. We apply ROP to samples across 2630 individuals from 54 diverse human tissues. Our approach can account for 99.9% of 1 trillion reads of various read length. Additionally, we use ROP to investigate the functional mechanisms underlying connections between the immune system, microbiome, and disease. ROP is freely available at https://github.com/smangul1/rop/wiki .

источник

16:20пожаловаться #6

R

Ruz in Science FYI

просто так взять

Речь была про привычные решения, даже когда есть проще и очевиднее. А заинтересованность в результате не всегда к нему приводит.

хех, про профдеформацию была шутка. Обсуждать неясные моменты - это имхо никак не признак решения вопроса привычным путем.

источник

16:20пожаловаться #7

п

просто так взять... in Science FYI

Ruz

хех, про профдеформацию была шутка. Обсуждать неясные моменты - это имхо никак не признак решения вопроса привычным путем.

Вот мне прямо сейчас наоборот показалось, но ок)

источник

16:26пожаловаться #8

VK

Viktoria Korzhova in Science FYI

https://jobs.msd.com/gb/en/event/5ed4f7d14cedfd0006d4264e/MSD-Invent-Impact-Inspire-Symposium?utm_source=Social%20Media&utm_medium=post%20sharing&utm_campaign=WAGSymposium
Monday, September 14, 2020 , 10:00 AM (CEST) - 3:00 PM (CEST)

источник

16:30пожаловаться #9

PD

Paulina D in Science FYI

Viktoria Korzhova

https://jobs.msd.com/gb/en/event/5ed4f7d14cedfd0006d4264e/MSD-Invent-Impact-Inspire-Symposium?utm_source=Social%20Media&utm_medium=post%20sharing&utm_campaign=WAGSymposium
Monday, September 14, 2020 , 10:00 AM (CEST) - 3:00 PM (CEST)

please register your attendance by 31Aug2020

источник

16:43пожаловаться #10

A

Anatoly in Science FYI

Ребят,очень извиняюсь за оффтоп,но никто случаем не знает способов повысить вероятность ложного негативного результата теста на ковид?кроме как попить и прополоскать горло перед началом процедуры?

источник

16:53пожаловаться #11

S

Sergei in Science FYI

Anatoly

Ребят,очень извиняюсь за оффтоп,но никто случаем не знает способов повысить вероятность ложного негативного результата теста на ковид?кроме как попить и прополоскать горло перед началом процедуры?

Не пихать палку в рот

источник

16:57пожаловаться #12

VK

Viktoria Korzhova in Science FYI

Paulina D

please register your attendance by 31Aug2020

Я читала невнимательно и успешно зарегистрировалась

источник

16:59пожаловаться #13

L

Litto_ral in Science FYI

Anatoly

Ребят,очень извиняюсь за оффтоп,но никто случаем не знает способов повысить вероятность ложного негативного результата теста на ковид?кроме как попить и прополоскать горло перед началом процедуры?

Я тоже извиняюсь, но вам зачем?

источник

17:02пожаловаться #14

A

Anatoly in Science FYI

Litto_ral

Я тоже извиняюсь, но вам зачем?

Обязательно нужно пройти,но хочу уменьшить риск что тест будет положителен

источник

17:03пожаловаться #15

L

Litto_ral in Science FYI

Anatoly

Обязательно нужно пройти,но хочу уменьшить риск что тест будет положителен

Это и так понятно. Но собираетесь ли вы после этого в любом случае сидеть на карантине? Или вы предлагаете нам помочь вам перемещаться с ложно-положительной справкой и способствовать распространению?

источник

17:05пожаловаться #16

AK

Anna Kravchenko in Science FYI

простите что я в белом пальто, но неужели настолько неотложные дела что они стоят того чтобы рисковать чужим здоровьем?

источник

17:05пожаловаться #17

M

MT in Science FYI

Theo

короче, я буду весьма признателен коучингу на тему "как свалить из науки и начать заниматься тем, что приносит удовольствие, не имея в этой сфере ни ьбразования, ни опыта, и это в чужой стране

Я сейчас перекатываюсь в датасаенс примерно по той же причине (правда, у меня нет детей, и жены нет, да и девушки тоже, да впрочем что я о нехорошем).

Я собираю полезные ссылки в канале @art_nnets, мб поможет

источник

17:06пожаловаться #18

СО

София Оксенойт... in Science FYI

Елизавета Макашова

Нейрофиброматоз – гетерогенная группа заболеваний, характеризующаяся появлением множественных опухолей центральной и периферической нервной системы. В настоящее время не разработаны единые подходы к диагностике и лечению этих пациентов, обсуждается возможность таргетной терапии. На совместной встрече YES ILAE, специалистов из НМИЦ нейрохирургии им. Н.Н. Бурденко и НИКИ педиатрии им. Ю.Е. Вельтищева мы обсудим новые тенденции в исследовании этого заболевания и различные методы лечения.
Когда? 10.09.2020 в 19.00
Программа:
1. Карандашева Кристина Олеговна, научный сотрудник лаборатории эпигенетики ФГБНУ "Медико-генетический научный центр им. Н.П. Бочкова. Клинико-генетическая характеристика пациентов с нейрофиброматозом. Необходимый объем обследования
2. Григорьева Антонина Васильевна, невролог НИКИ педиатрии и детской хирургии им. ак. Ю.Е. Вельтищева. Эпилепсия у пациентов с нейрофиброматозом I и II типов: клинические особенности и принципы терапии
3. Макашова Елизавета Сергеевна, невролог НМИЦ нейрохирургии им. ак. Н.Н. Бурденко. Перспективы лечения нейрофиброматоза. Новые тенденции в лечении нейрофиброматоза II типа

Подключиться к конференции Zoom
https://us02web.zoom.us/j/84077481348?pwd=Uzl4VkFBSTBtSGhxSjgzMGNKTkdsQT09

Идентификатор конференции: 840 7748 1348
Код доступа: 513104

Zoom Video

Join our Cloud HD Video Meeting

Zoom is the leader in modern enterprise video communications, with an easy, reliable cloud platform for video and audio conferencing, chat, and webinars across mobile, desktop, and room systems. Zoom Rooms is the original software-based conference room solution used around the world in board, conference, huddle, and training rooms, as well as executive offices and classrooms. Founded in 2011, Zoom helps businesses and organizations bring their teams together in a frictionless environment to get more done. Zoom is a publicly traded company headquartered in San Jose, CA.

мне очень бы хотелось присутствовать, но уже должна быть на другом зуме. Может быть будет запись?

источник

17:20пожаловаться #19

IZ

I Z in Science FYI

Anatoly

Обязательно нужно пройти,но хочу уменьшить риск что тест будет положителен

Ээ... Чет как-то плоховато выглядит мотив в отсутствие деталей...

источник

17:52пожаловаться #20