Size: a a a

2020 September 05

VS

V S 🦠 in Science FYI
Я разбавляю рабочие растворы водой. Они прекрасно в 10х лежат в темном пакетике долго
источник

VS

V S 🦠 in Science FYI
Dmitry Dianov
Каман, вы таки правда думаете, что для разделения разных диапазонов масс нужен одинаковый процент геля? Если я правильно понимаю ваш подкол.
Я к тому, что в 2% агарозе не увидеть 10кб. Равно как и 100пн в 0.2%
источник
2020 September 06

V

VAS in Science FYI
Александр Грицай
Хм, надо будет попробовать.
Разбавлять Сибр можно водой или буффером. Ленивый вариант: иметь мастер микс с буффером для загрузки ДНК, чтобы просто разом добавлять в образец. Стоит заметить, что предсмешанные красители, особенно если ещё SDS, могут влияить на скорость хода и интенсивность окрашивания, но обычно прокатывает (и сильно экономит краситель и время). Также замечу, что совсем правильный вариант - не в гель, а пост окрашивание.
По поводу плотности геля, могу посоветовать загуглить картинку с одной и той же линейкой в гелях разной плотности, чтобы лучше понимать, что как разделяется (спойлер - всё хорошо не разделить). Но не знаю, как Вы, а я 2% гели растапливал и заливал с трудом, и подозреваю, что в литературе больше 2% не упоминают, потому, что их нереально сделать. (хотя агароза с модифицированными свойствами тоже бывает, но это извращенство). Будте осторожны с советами 2.5+%
Общий рецепт лучшего разделения: гнать на более низкой силе тока - и просто медленее и холоднее, я помню в спрингере протокол уровня 4С 40V на ночь из 80х (пробовать не стоит). Проблема, что 100bp и подобные будут чуть более разпозползшиеся из-за диффузии
источник

SV

Semen Vasilev in Science FYI
Aleksandra S
Подскажите, пожалуйста, кто имел дело с РНФ\РФФИ. Есть ли где-то список неформальных требований к заявкам? Т.е. то, что не указано в конкурсной документации, но подразумевается. Например, мы только от рецензентов узнали, что в заявке на молодежный грант нужно обязательно иметь старших коллег.
Это какая-то инициатива рецензента. Имеет смыл написать в фонд, что лажа в рецензии. По своему случаю ничего не измените , но есть шанс, что рецензент подучит по мозгам
источник

SV

Semen Vasilev in Science FYI
Rafael Grigoryan
Я как-то раз видел в рецензии на программу под названием литералли "мой первый грант" замечание о том, что у руководителя маловато опыта руководства грантами.
Антологичный совет, что и выше
источник

AS

Aleksandra S in Science FYI
Semen Vasilev
Это какая-то инициатива рецензента. Имеет смыл написать в фонд, что лажа в рецензии. По своему случаю ничего не измените , но есть шанс, что рецензент подучит по мозгам
Спасибо. Мы написали об этом в фонд. Но это было в отзывах 2 рецензентов из 3, т.е. я подозреваю что это нечто общепринятое. Сказали, что руководитель всем хорош, но всё-таки нет уверенности выполнения задачи (возьмите в группу старшего опытного) и что группа не сработанная (нет совместных публикаций всех вместе). Все это при том, что грант молодежный.
источник

VP

Vasily Popkov in Science FYI
Aleksandra S
Подскажите, пожалуйста, кто имел дело с РНФ\РФФИ. Есть ли где-то список неформальных требований к заявкам? Т.е. то, что не указано в конкурсной документации, но подразумевается. Например, мы только от рецензентов узнали, что в заявке на молодежный грант нужно обязательно иметь старших коллег.
Ага. А если бы был - написали бы, что по условиям конкурса запрещено иметь людей, кому руководитель подчиняется по должности
источник

VP

Vasily Popkov in Science FYI
Aleksandra S
Спасибо. Мы написали об этом в фонд. Но это было в отзывах 2 рецензентов из 3, т.е. я подозреваю что это нечто общепринятое. Сказали, что руководитель всем хорош, но всё-таки нет уверенности выполнения задачи (возьмите в группу старшего опытного) и что группа не сработанная (нет совместных публикаций всех вместе). Все это при том, что грант молодежный.
А про опыт - это любимый Кек молодёжных грантов. Бедные рецензенты каждый раз удивляются, что на маленькие молодёжные подаются люди без опыта руководства.
источник

AZ

Arthur Zalevsky in Science FYI
Vasily Popkov
А про опыт - это любимый Кек молодёжных грантов. Бедные рецензенты каждый раз удивляются, что на маленькие молодёжные подаются люди без опыта руководства.
ты как-будто обычные вакансии не видел. на джуниора надо минимум лет 5 опыта работы по профилю) а самый лол, когда для итшников требуют, условно, 10 лет опыта работы в фреймворке, который, в принципе, существует 7-8 лет xD
источник

VP

Vasily Popkov in Science FYI
Arthur Zalevsky
ты как-будто обычные вакансии не видел. на джуниора надо минимум лет 5 опыта работы по профилю) а самый лол, когда для итшников требуют, условно, 10 лет опыта работы в фреймворке, который, в принципе, существует 7-8 лет xD
Где-то был скрин, когда этого требовали от создателя оного)
источник

АГ

Александр Грицай... in Science FYI
VAS
Разбавлять Сибр можно водой или буффером. Ленивый вариант: иметь мастер микс с буффером для загрузки ДНК, чтобы просто разом добавлять в образец. Стоит заметить, что предсмешанные красители, особенно если ещё SDS, могут влияить на скорость хода и интенсивность окрашивания, но обычно прокатывает (и сильно экономит краситель и время). Также замечу, что совсем правильный вариант - не в гель, а пост окрашивание.
По поводу плотности геля, могу посоветовать загуглить картинку с одной и той же линейкой в гелях разной плотности, чтобы лучше понимать, что как разделяется (спойлер - всё хорошо не разделить). Но не знаю, как Вы, а я 2% гели растапливал и заливал с трудом, и подозреваю, что в литературе больше 2% не упоминают, потому, что их нереально сделать. (хотя агароза с модифицированными свойствами тоже бывает, но это извращенство). Будте осторожны с советами 2.5+%
Общий рецепт лучшего разделения: гнать на более низкой силе тока - и просто медленее и холоднее, я помню в спрингере протокол уровня 4С 40V на ночь из 80х (пробовать не стоит). Проблема, что 100bp и подобные будут чуть более разпозползшиеся из-за диффузии
Спасибо большое! Будем пробовать
источник

Н(

Набор букв (киррилиц... in Science FYI
Вопрос: кто работал на Serial cloner?
Каково на него перейти с Вектора/Юджина?
источник

O

Orodret in Science FYI
Aleksandra S
Спасибо. Мы написали об этом в фонд. Но это было в отзывах 2 рецензентов из 3, т.е. я подозреваю что это нечто общепринятое. Сказали, что руководитель всем хорош, но всё-таки нет уверенности выполнения задачи (возьмите в группу старшего опытного) и что группа не сработанная (нет совместных публикаций всех вместе). Все это при том, что грант молодежный.
Нет, старших коллег не надо. Это как раз странно, если члены старше руководителя. Про сработанность - да, целостность коллектива смотрят по совместным публикациям. В идеале, с каждым членом у руководителя должна быть минимум одна совместная публикация. И опыт членов тоже публикациями подтверждается. Вы ж расписываете, какие у вас задачи в заявке? Соответственно,  в коллективе должен быть хоть один человек, который умеет такую задачу решить. И это должно быть подтверждено публикацией с его авторством.
источник

O

Orodret in Science FYI
Vasily Popkov
А про опыт - это любимый Кек молодёжных грантов. Бедные рецензенты каждый раз удивляются, что на маленькие молодёжные подаются люди без опыта руководства.
Ну, всешда ж есть всякие конкурсы для студентов и тд
источник

VP

Vasily Popkov in Science FYI
Orodret
Ну, всешда ж есть всякие конкурсы для студентов и тд
Примеры? Кроме мол-а, которого фиг знает сколько не было. А даже если был, с определённого момента как-то не солидно. Именно гранты, а не конкурсы и стипендии
источник

O

Orodret in Science FYI
Vasily Popkov
Примеры? Кроме мол-а, которого фиг знает сколько не было. А даже если был, с определённого момента как-то не солидно. Именно гранты, а не конкурсы и стипендии
Хз, я всегда указывал победу в кнвш от правительства спб. Думаю, в мск что-то такое тоже есть. И конкурсы и стипендии тоже норм, если они на науку, а не учебу
источник

VP

Vasily Popkov in Science FYI
Orodret
Хз, я всегда указывал победу в кнвш от правительства спб. Думаю, в мск что-то такое тоже есть. И конкурсы и стипендии тоже норм, если они на науку, а не учебу
Ну вот моему рецензенту было пофигу на весь список)
источник

O

Orodret in Science FYI
Vasily Popkov
Ну вот моему рецензенту было пофигу на весь список)
Ну, там да, рейензент всегда найдёт, к чему придраться. Но отрицательная рецензия - не приговор
источник

VP

Vasily Popkov in Science FYI
Ага) а положительная - не гарантия
источник

O

Orodret in Science FYI
Vasily Popkov
Ага) а положительная - не гарантия
Кхм... вспоминаем экспансию))
источник