Size: a a a

2020 May 08

U

Ulyana in Science FYI
Но ещё же есть НГУ с тусовочкой...
источник

С

Саша in Science FYI
Arthur Zalevsky
Ну.. аксакалы говорят, что тусовочка во многом зародилась в 50х с семинаров Гельфанда. Который Израиль Моисеевич, конечно. А из нее уже вышли все почти все текущие "старшие" биоинформатики.

Вот цитата по младшему Гельфанду:

Факт 3. Отцами российской биоинформатики Михаил Гельфанд называет эволюционного биолога Евгения Кунина и вирусолога Александра Горбаленю. Первый сейчас живет и работает в США, а второй – в Нидерландах. Из ученых, работающих половину времени в США, половину времени в России – известные российские биоинформатики Алексей. Кондрашов и Павел Певзнер. А среди биоинформатиков, оставшихся в России, Гельфанд выделяет Андрея Миронова и Михаила Ройтберга.

Я правда не очень знаю в какой момент появилась питерская школа, в частности Алла Лапидус :( но они все равно из одной тусовки.
Спасибо!
источник

AZ

Arthur Zalevsky in Science FYI
мб @abeliavskaia @orodret @apredeus смогут про это чуть подробнее сказать
источник

M

Mr.britva in Science FYI
Ulyana
Но ещё же есть НГУ с тусовочкой...
+
источник

AZ

Arthur Zalevsky in Science FYI
Ulyana
Но ещё же есть НГУ с тусовочкой...
безусловно. свои биоинф тусовочки сейчас есть везде. и в новосибе, и в красноярске, и в казани. и тот же Михаил Сергеевич очень много делает, чтобы поддерживать контакты между этими ячейками. Чтобы народ оттуда постоянно как-то общался.
источник

AZ

Arthur Zalevsky in Science FYI
Ulyana
Но ещё же есть НГУ с тусовочкой...
но, гм, я не знаю биоинформатиков из новосиба уровня Кунина, Горбалени, Кондрашова или Певзнера.
источник

M

Mr.britva in Science FYI
Arthur Zalevsky
безусловно. свои биоинф тусовочки сейчас есть везде. и в новосибе, и в красноярске, и в казани. и тот же Михаил Сергеевич очень много делает, чтобы поддерживать контакты между этими ячейками. Чтобы народ оттуда постоянно как-то общался.
В сибе тусовка довольно давно, емнип ещё с советских времен кто-то был. Там все выросло из генетики
источник

O

Orodret in Science FYI
Arthur Zalevsky
мб @abeliavskaia @orodret @apredeus смогут про это чуть подробнее сказать
Алла Львовна вроде с Певзнером появилась.
источник

DA

Dmitry A in Science FYI
Orodret
Алла Львовна вроде с Певзнером появилась.
Не совсем. С О'Брайаном
источник

O

Orodret in Science FYI
Dmitry A
Не совсем. С О'Брайаном
А, может)) я просто с ней уже в цабе познакомился
источник

B

Brenoritvrezorkre in Science FYI
Социология биоинформатики
источник

КЕ

Кирилл Ермин... in Science FYI
Да, очень интересно.
Интересно, будет ли поддержано это направление ретроспективных поисков.
источник

АС

Александр Смирнов... in Science FYI
German
Чехия по кейсам вроде тоже уже того-сего, последняя надежда на Россию осталась)
Можно же Польшу ещё попробовать. Или нет?
источник

AK

Alexandra K in Science FYI
Arthur Zalevsky
но, гм, я не знаю биоинформатиков из новосиба уровня Кунина, Горбалени, Кондрашова или Певзнера.
Забавный факт в том, что если посмотреть, откуда постоянные сотрудники и соавторы Кунина Кира Макарова и Юрий Вольф, то окажется, что они закончили аспирантуру новосибирского ИЦиГа.
источник

F

Fedor in Science FYI
Arthur Zalevsky
но, гм, я не знаю биоинформатиков из новосиба уровня Кунина, Горбалени, Кондрашова или Певзнера.
В Новосибирске они скромные. Работают спокойно.
источник

F

Fedor in Science FYI
Arthur Zalevsky
но, гм, я не знаю биоинформатиков из новосиба уровня Кунина, Горбалени, Кондрашова или Певзнера.
Занимаются локальными проблемами: геном лисицы (дружелюбной, агрессивной, нормальной), геном описторха, геном пшеницы....
источник

M

Mr.britva in Science FYI
Fedor
Занимаются локальными проблемами: геном лисицы (дружелюбной, агрессивной, нормальной), геном описторха, геном пшеницы....
Лисица - не совсем локальная проблема. Они фактически изучают одомашнивание и роль наследственности в контроле поведения. Почему на лисицах - отдельный разговор, но так исторически сложилось
источник

F

Fedor in Science FYI
ИЦиГ СО РАН
источник

AZ

Arthur Zalevsky in Science FYI
Alexandra K
Забавный факт в том, что если посмотреть, откуда постоянные сотрудники и соавторы Кунина Кира Макарова и Юрий Вольф, то окажется, что они закончили аспирантуру новосибирского ИЦиГа.
коллеги, искренне извиняюсь, если это прозвучало не очень тактично. безусловно, за мкадом жизнь есть (я так-то тоже из понаевших и выбирал между ФББ и ФЕНом). и, безусловно, люди в биоинформатику приходили из разных мест и с разным бэкграундом.  особенно в самом начале - в 80-90х, когда никакой специальной биоинформатики еще не было, а люде на коленке и грэпе делали статьи, которые теперь цитируются дестяками тысяч. и под свои задачи и интересы возникали свои локальные тусовочки.
источник

F

Fedor in Science FYI
Arthur Zalevsky
но, гм, я не знаю биоинформатиков из новосиба уровня Кунина, Горбалени, Кондрашова или Певзнера.
Про арабидопсис работы из Новосиба:
Pasternak, T., Groot, E. P., Kazantsev, F. V., Teale, W., Omelyanchuk, N., Kovrizhnykh, V., ... & Mironova, V. V. (2019). Salicylic acid affects root meristem patterning via auxin distribution in a concentration-dependent manner. Plant physiology, 180(3), 1725-1739.
Stigliani, A., Martin-Arevalillo, R., Lucas, J., Bessy, A., Vinos-Poyo, T., Mironova, V., ... & Parcy, F. (2019). Capturing auxin response factors syntax using DNA binding models. Molecular plant, 12(6), 822-832.
Mironova, V., & Xu, J. (2019). A single-cell view of tissue regeneration in plants. Current opinion in plant biology, 52, 149-154.
источник