AB
Геном хозяина референс есть?
Ноуп.
Size: a a a
2019 December 02
AB
Геном хозяина референс есть?
А почему вы спрашиваете? В смысле какая идея? =)
SK
А почему вы спрашиваете? В смысле какая идея? =)
pair end риды и найти вставку
AB
pair end риды и найти вставку
Тоже можно, да. Спасибо.
AB
А еще такой вопрос: чем нынче собирают эукариотические геномы из коротких прочтений? Я со своей нанопорой совсем этого не знаю.
SK
Я что-то не помню там каких то прорывов
SK
А еще такой вопрос: чем нынче собирают эукариотические геномы из коротких прочтений? Я со своей нанопорой совсем этого не знаю.
кстати, а есть же проги на основе HMM чтобы выделать бактериальные участки в геноме - можно попробовать
AB
Я что-то не помню там каких то прорывов
а что было до прорывов?)
SK
Когда я юзал SPAdes, хз, сота сейчас или нет
SK
(поддержи отечественного производителя)
AB
Spades не создан для больших геномов, это бактериальный в основном сборщик. Впрочем я уже запустила =D
AB
Он как раз отличный, развивается и поддерживается.
O
У меня вызывает сомнение соотношение размеров, будет ли светиться. Геном хозяина типа 6 гб, бактерии 1 мб
Как ты такие геномы подобрала?😅
AB
Как ты такие геномы подобрала?😅
Это матушка природа..
MR
А еще такой вопрос: чем нынче собирают эукариотические геномы из коротких прочтений? Я со своей нанопорой совсем этого не знаю.
А что с гетерозиготностью? Если высокая, то Platanus.
AB
А что с гетерозиготностью? Если высокая, то Platanus.
С гетерозиготностью к сожалению все отлично!
AB
Спасибо!
2019 December 03
AK
Коллеги, есть PhD из Швейцарии? Хотелось бы задать вам кучу вопросов по поводу апликейшена
IO
German
товарищи, сто раз тут поднимался вопрос уже - а что еще научному работнику надо приносить на собеседование на J1? CV, список статей, письмо от научника чем заниматься будет, еще что-то?
форму DS-2019; бумагу о наличии PhD, если есть такая
G
форму DS-2019; бумагу о наличии PhD, если есть такая
Пасип :) бумаги пока нет но надеюсь будет