PD
Ребята, а чем вы придумываете праймеры для реалтайм-ПЦР? Глазами али каким автоматическим тулом?
Size: a a a
2019 December 02
AB
Тем же самым что и для обычного пцр, но ставишь только размер продукта в районе сотни бп
PD
Тем же самым что и для обычного пцр, но ставишь только размер продукта в районе сотни бп
а вот чем самым для обычной пцр? там же 100500 тулов в гугле
AB
Primer blast
PD
Primer blast
ок, спасибо
S
Ребята, а чем вы придумываете праймеры для реалтайм-ПЦР? Глазами али каким автоматическим тулом?
O
Primer blast
+++. Еще у термофишер есть свой калькулятор, который тм для их полимераз считает.
ПМ
Профессиональные учёные, подскажите, что по доказательной базе у мексидола и холина альфосцерата?
Вопрос все еще интересен
PD
+++. Еще у термофишер есть свой калькулятор, который тм для их полимераз считает.
подождите, разве тм -- это характеристика не куска нуклеиновой кислоты?
O
подождите, разве тм -- это характеристика не куска нуклеиновой кислоты?
Да, но термофишер считает, что для его полимераз ее надо считать по-другому. Я не вдавался в подробности, как оно работает. Есть подозрение, что дело в буфере. Он тоже на тм влияет по иден.
PD
Да, но термофишер считает, что для его полимераз ее надо считать по-другому. Я не вдавался в подробности, как оно работает. Есть подозрение, что дело в буфере. Он тоже на тм влияет по иден.
а, ну буфер ок
PD
а праймер-бласт проверяет, чтобы придумываемые им праймеры отжигались только на тот ген, на который я их прошу отжечься?
PD
или надо дополнительно бластить за ним?
AB
У разных полимераз разная температура элонгации
AB
Чаще всего 72, но есть исключения. Longamp например 65.
O
а праймер-бласт проверяет, чтобы придумываемые им праймеры отжигались только на тот ген, на который я их прошу отжечься?
Ему можно указать набор последовательностей, куда он пробует праймеры отжигать. Соответственно можно смотреть количество матчей
PD
Ему можно указать набор последовательностей, куда он пробует праймеры отжигать. Соответственно можно смотреть количество матчей
ээээ, мой набор последовательностей -- все кДНК, руками их не переберёшь
O
ээээ, мой набор последовательностей -- все кДНК, руками их не переберёшь
Ну, у вас ведь не инопланетная кДНК)) в смысле, ему можно ограничить поиск до организма
PD
Ну, у вас ведь не инопланетная кДНК)) в смысле, ему можно ограничить поиск до организма
так, а чем тогда эта фича праймер-бласта отличается от бластн-а?