Marina Afanasyeva
Всем привет! Ищу, кто может мне помочь разобраться с одной lincRNA. Кто шарит? Мне надо понять, существует ли она реально (ее нет в Genome Browser, а в ZENBU её место относят к нетранслируемой части IKZF3) и как детектировать её риал-таймом? Она есть в DIGE и Ensemble, но там мало инфы и нет экзон-интронной структуры.
надо заказать праймеры для реал-тайма под ее последовательность, желательно к нескольким участкам, и чтобы не перекрывались с другими генами. Выделить РНКу из образца, где вы подозреваете, что она есть. Обработать ДНКазой. Прогнать RT с контрольным образцом из того же сэмпла но без обратной транскриптазы. Прогнать Real-time, если есть сигнал в образце с обратной транскриптазы, но нет или мало без - наверно есть какой-то транскрипт