Size: a a a

2019 November 06

H🐈

Hidden 🐈 Markov 🐈 Mo... in Science FYI
Marianna Weymore
Вот это было бы здорово! Тоже хочу знать
вот ответ
источник

M

Marianna Weymore in Science FYI
Теперь вижу, спасибо!
источник

O

Orodret in Science FYI
Maria Uzun
Всем привет!
Может кто-нибудь сможет помочь с доступом к кластеру с большим количеством оперативки? Очень нужно единоразово обсчитать большое количество данных с нанопроры.  🙏🙏 Готовы обсудить любые условия
Там оперативка не особо нужно, много гпу и норм. Без гпу особо смысла нет
источник

O

Orodret in Science FYI
Nikolay Kulemin
У нас образцы более суток не считаются, на 28 ядрах
На процах нанопору такое себе считать
источник

NK

Nikolay Kulemin in Science FYI
Orodret
На процах нанопору такое себе считать
Лучше на видео?
источник

H🐈

Hidden 🐈 Markov 🐈 Mo... in Science FYI
интересная статистика по миграции среди ученых — кто куда мигрировал

видно, что в Европе очень развито движение между разными странами внутри региона

из Азии массово (почти треть) ученых сваливает в Америку (Северную/Южную)

из Америки немножко едут в Европу и еще меньше едут в Азию

из Европы много мигрируют в Америку, немножко в Азию, совсем мало в Океанию

https://towardsdatascience.com/analyse-the-migration-of-scientific-researchers-5184a9500615
источник

O

Orodret in Science FYI
Nikolay Kulemin
Лучше на видео?
Да. У нас коллинг одной ячейки на 72 потока на процах чет больше недели занимает, когда на 2080 за пару часов все отрабатывает
источник

NK

Nikolay Kulemin in Science FYI
Orodret
Да. У нас коллинг одной ячейки на 72 потока на процах чет больше недели занимает, когда на 2080 за пару часов все отрабатывает
Ну я не работал с нанопором, но охотно верю
источник

D[

Dmitry Demruno [Ru,M... in Science FYI
Hidden 🐈 Markov 🐈 Model
интересная статистика по миграции среди ученых — кто куда мигрировал

видно, что в Европе очень развито движение между разными странами внутри региона

из Азии массово (почти треть) ученых сваливает в Америку (Северную/Южную)

из Америки немножко едут в Европу и еще меньше едут в Азию

из Европы много мигрируют в Америку, немножко в Азию, совсем мало в Океанию

https://towardsdatascience.com/analyse-the-migration-of-scientific-researchers-5184a9500615
А рассеюшка к Азии или к Европе относится ь
источник

H🐈

Hidden 🐈 Markov 🐈 Mo... in Science FYI
Dmitry Demruno [Ru,Msk]
А рассеюшка к Азии или к Европе относится ь
третий путь
источник

AZ

Arthur Zalevsky in Science FYI
Maria Uzun
Минимум 70 гб оперативки (вообще  хорошо было бы 100), и 100 гб на жестком диске 😐
если надо срочно и не взлетит с облаком, напишите мне)
источник

O

Orodret in Science FYI
Maria Uzun
Всем привет!
Может кто-нибудь сможет помочь с доступом к кластеру с большим количеством оперативки? Очень нужно единоразово обсчитать большое количество данных с нанопроры.  🙏🙏 Готовы обсудить любые условия
Да, кстати, если что, с нанопорой работал, можете мне тоже написать, если нужно))
источник

AB

Alex Beliavskaia in Science FYI
Maria Uzun
Всем привет!
Может кто-нибудь сможет помочь с доступом к кластеру с большим количеством оперативки? Очень нужно единоразово обсчитать большое количество данных с нанопроры.  🙏🙏 Готовы обсудить любые условия
А что вы подразумеваете под обсчитать?
источник

AB

Alex Beliavskaia in Science FYI
Orodret
Там оперативка не особо нужно, много гпу и норм. Без гпу особо смысла нет
Оперативка не особо роляет, да, но без гпу мы спокойненько живем.
источник

AB

Alex Beliavskaia in Science FYI
Когда у меня был большой кусок данных типа 15 гигабаз аккуратный бейсколлинг дейсвительно занял пару дней, но в следующий раз я просто ручками поделила на 5 кусков и запустила на разных машинах
источник

O

Orodret in Science FYI
Alex Beliavskaia
Оперативка не особо роляет, да, но без гпу мы спокойненько живем.
И сколько у вас гуппи коллит? Кста, и ракон и медака сейчас на гпу живут))
источник

AB

Alex Beliavskaia in Science FYI
Orodret
И сколько у вас гуппи коллит? Кста, и ракон и медака сейчас на гпу живут))
R9 или R10? Вторая будет кстати коллить раз в пять кажется медленнее
источник

AZ

Arthur Zalevsky in Science FYI
Alex Beliavskaia
Оперативка не особо роляет, да, но без гпу мы спокойненько живем.
хм. Мои коллеги сказали, что даже простенькие гпу делают это намного быстрее, чем цпу.
источник

O

Orodret in Science FYI
Alex Beliavskaia
Когда у меня был большой кусок данных типа 15 гигабаз аккуратный бейсколлинг дейсвительно занял пару дней, но в следующий раз я просто ручками поделила на 5 кусков и запустила на разных машинах
Ну как бы ячейка, если без баркодов - это обычно от 15 гб и получается. И да, делить на пять машин - это не очень "спокойно живем"
источник

AB

Alex Beliavskaia in Science FYI
Arthur Zalevsky
хм. Мои коллеги сказали, что даже простенькие гпу делают это намного быстрее, чем цпу.
Наверняка, мой пойнт был, что все-таки можно и по старинке
источник