Size: a a a

2019 August 25

SK

Sergey Kolchenko in Science FYI
**** онанизм
источник

SK

Sergey Kolchenko in Science FYI
Посоны, а есть у кого best practices по хранению, организации и спользованию всяких мета данных, аннотаций, вот это все, в биоинформатической лабе?
Ну вот у нас есть несколько версий генома, несколько версий моделей генов, как лучше хрнаить и трекать че куда замаппено и какая версия была использована?
источник

AS

Alex Shynkarenko in Science FYI
источник

🚑

🚑🚑🚑 in Science FYI
Sergey Kolchenko
Посоны, а есть у кого best practices по хранению, организации и спользованию всяких мета данных, аннотаций, вот это все, в биоинформатической лабе?
Ну вот у нас есть несколько версий генома, несколько версий моделей генов, как лучше хрнаить и трекать че куда замаппено и какая версия была использована?
Интересно, насколько актуально было аналог гитхаба запилить для подобных сфер
источник

SK

Sergey Kolchenko in Science FYI
Ну просто для мл моделей я примерно вижу что есть
источник

SK

Sergey Kolchenko in Science FYI
Для биоинфы с нашей кучей форматов... Мб можно адаптивароть
источник

AM

Ai Med in Science FYI
#новости #медтех

Предсказание даты смерти: как далеко продвинулись учёные?

Несколько дней назад в Nature было опубликовано исследование группы учёных из стран ЕС и Великобритании, которые смогли выявить зависимость между определёнными показателями в крови и риском наступления смерти в ближайшие 5-10 лет.

Авторы подчеркивают, что это самое масштабное исследование, когда-либо проведенное в этой области. Исследователи изучили результаты анализов крови 44168 европейцев в возрасте от 18 до 109 лет, хранящиеся в различных медицинских базах данных, причем каждый из пациентов сдавал кровь по меньшей мере дважды.

Изначально ученым удалось установить 136 биомаркеров, связанных с той или иной причиной смерти, однако подавляющее большинство из них оказались сильно взаимозависимыми. В итоге, учёные установили 14 биомаркеров, анализ которых позволяет предсказать вероятность наступления смерти от всех причин в течение ближайших 5-10 лет с точностью более 80%.

Статья в Nature тут же вызвала лавину публикаций в СМИ с кликбейтными заголовками типа "Учёные разработали тест на определение даты смерти". Исследование интересное, но проверившие его независимые эксперты подчёркивают, что его выводы не применимы в клинической работе. Более того, вероятность валидации данных для такой широкой когорты людей достаточно низка.

Тем не менее, исследование стоит изучить разработчикам диагностических сервисов на основе искусственного интеллекта. Если сделать выборку более узкой и валидировать данные, может получиться рабочий интересный инструмент.

Подробнее об исследовании: https://www.sciencealert.com/new-blood-test-could-help-predict-your-risk-of-death-in-the-next-10-years

@medicalksu
источник

Е

Екатерина in Science FYI
Заведующий всем
чатик, стоит ли подаваться в магу за границу на около-биотехнологию?
если да, то куда?
с какими навыками охотнее возьмут?
А чего хочется в итоге?
источник

VP

Vasily Popkov in Science FYI
Коллеги. А случайно никто не знает, как в шкафах для животных избегают сквозняков?
источник

VP

Vasily Popkov in Science FYI
источник

VP

Vasily Popkov in Science FYI
Типо таких. Фильтры и вентиляторы это ясно. А вот что со сквозняками мне из описания не ясно
источник

BK

Bogdan Kirillov in Science FYI
Котофеи и котофеишны, есть у кого анатомический атлас Пернкопфа в пдф?
источник

Яс

Я собака in Science FYI
@apredeus можете как-то прокомментировать?
источник

Яс

Я собака in Science FYI
Продолжаем лить инсайды - известная платформа Oxford Nanopore в фоновом режиме отправляет сиквенсы на сервера производителя.
источник

VI

Viacheslav Ivanov in Science FYI
Sergey Kolchenko
Посоны, а есть у кого best practices по хранению, организации и спользованию всяких мета данных, аннотаций, вот это все, в биоинформатической лабе?
Ну вот у нас есть несколько версий генома, несколько версий моделей генов, как лучше хрнаить и трекать че куда замаппено и какая версия была использована?
Если разберёшься, напиши об этом кратенько, пожалуйста, а то очень насущная проблема
источник

O

Orodret in Science FYI
Я собака
Продолжаем лить инсайды - известная платформа Oxford Nanopore в фоновом режиме отправляет сиквенсы на сервера производителя.
Нет. Там телеметрия, не более
источник

SK

Sergey Kolchenko in Science FYI
Viacheslav Ivanov
Если разберёшься, напиши об этом кратенько, пожалуйста, а то очень насущная проблема
Я спрошу в универе, мб есть чисто биоинф лабы, поговорю с ними
источник

O

Orodret in Science FYI
Я собака
Продолжаем лить инсайды - известная платформа Oxford Nanopore в фоновом режиме отправляет сиквенсы на сервера производителя.
И да, один запуск дает около 0,5 тб, такое в принципе тяжело в фоновом режиме переслать
источник

V

Victor in Science FYI
Vasily Popkov
Коллеги. А случайно никто не знает, как в шкафах для животных избегают сквозняков?
Если по-хорошему достаточно делать сквозняк снизу или сверху от ячейки (в зависимости от температуры)
источник

JC

Joshua Clear in Science FYI
Мир Вам, знающие!
Подскажите, кто сталкивался, как скачать опросник из supplementary materials? Через sci-hub доступна только статья.
источник