как вижу индекс должен быть составной и состоять из трех полей:
id, item_id, stat
в след. порядке
stat
item_id
id
причем можно поиграть с этим. возможно, ускорит
немного ускорит, т.к. будет только Using index, т.е. все выбираемые данные будут находится в индексе, но не слишком сильно, т.к. всё-равно необходимо будет весь индекс сканить