Иван
Есть такое мнение
- п.3, ч.II закрепляет, что безопасность с использованием СКЗИ обеспечивает лицензиаты ФАПСИ;
- п.4, ч.II отдельно указано, что если обладатель не лицензиат, то он обращается к лицензиату;
- п.6, ч.II закрепляет, что лицензиат создает орган(ы).
Таким образом, орган может быть только в лицензиате.
Волнующая Вас запятая, просто перечисление.
Союз "или" не используется, т.е. вариативность отпадает.
А как можно быть лицензиатом фапси если организации нет больше?