Как следствие: сервис, которому я отправляю кодированный bas64 из jmeter, не понимает что я прислал, а кодированный base64 с https://www.base64encode.org/ понимает

Можно попробовать явно кодировку задать, вторым параметром (предположительно UTF-8 нужна):
File encoding: if not the platform default The encoding to be used to read the file. If not specified, the platform default is used.

ты перед кодированием на ресурсе так же файл в стрингу переводишь? Этой же функцией?

Нет, я в ресурс складываю тот же файлик, который в jmeter преобразую в строку, а затем кодирую

Вероятно, на ресурсе byte[], который без преобразования в строку переводится в Base64

аналогично и у твоего сервиса

А в jmeter можно как-то без преобразования в строку кодировать в base64?

groovy/java c помощью jsr223

вопрос к знатокам, предположим вам дали новую систему - нужно провести стандартный цикл работ: максперф, подтверждение максимума, стабилити, может какой-то стресс. каждый тест чем-то аргументирован. у вас есть показатели интенсивностей, снятые с аналогичной системы. предположим пик на той системе был 20 рпс, такой очень слабонагруженный сервис.
и вот вы начали искать максимум, а он не ищется. дошли до 2000 рпс и только 20% утилизации процессора тачки. машины "как на проме". будете дожимать до упора или еще какие то варианты?)

Про профиль нагрузки ничего не сказано

Остановиться , в отчётах указать максимум выше хх уровня , уточнить у заказчика уже после - хочет ли

Предполагаю, что раз дошли до 2000 рпс не нагружая систему, есть проблемы либо с профилем, либо со скриптами

А, я подразумевал что всё норм ) ну и система новая может супер-огонь

Новая система никогда не бывает огонь))

В плане нагрузки

Здесь смысл ещё в том, что с багами - узкими местами на огромной нагрузке никто ничего делать не будет, зачем их искать тогда

нет профиль отличный, простенький сайтик, авторизация, потом показывает твой баланс какой-ниубдь и потом ты можешь какую-то простенькенькую настройку сделать

5 операций

передается только токен

Почему же - перевели на какой нибудь микросервис и завели в сотни подов ;)