В usb, как и в pcie, скорость завязана на generation. 3.2 больше о всяких разъёмах (они только type-c оставили).
Короче, стандарт вроде не требует прямо на phy глаз считывать. Там вроде как требования к глазу на коннекторе и к insertion loss на плате.
Иная ситуация с мультигигабитными PHY для последних pcie (pam4). Там в фронт энде в любом случае стоит небольшой АЦП (flash, если я правильно помню) и есть возможность смотреть осциллограмму прямо с чипа. Читать по низкоскоростному интерфейсу, что туда прилетает