rewrite ^/(v1|v2)/$ /repository/docker-group/$1/ last;
rewrite ^/(v1|v2)/(.*)$ /repository/docker-group/$1/$2 last;
rewrite ^/(v1|v2)/([-_0-9a-z]+)/(.*)$ /repository/$2/$1/$3 last;
Как вы видите, здесь используются регулярки под которые у вас подойдут ваши 250 реп без проблем