А текущие панели останутся, или всё слетит

Так у тебя же есть файл. Сохрани его до того менять. Если слетит (в чем я не уверен), то можно будет все вернуть обратно.

А если нет файла automation.yaml куда вносить автоматизацию, если делал по инструкциям Квазиса? Собрал gyver лампу, для управления режимами ,необходимо внести код в этот файл

можно и configuration.yaml

либо можно вписать в configuration.yaml строку

automation: !include automations.yaml

и дальше уже писать все в automations.yaml

Вообще, обычно файл automations.yaml сразу есть

Его может не быть только если ты сам его удалил.
Может быть, просто не там его ищеешь?

Я его удалил, все вынесено в папку include, но его нет.

Да, есть разные подходы к тому как нужно разбивать конфиги HA

Кому как удобнее

Вот это нужно внести в automation:

- alias: Gyver Speed
 trigger:
   platform: state
   entity_id: input_number.speed
   
 action:
   - service: mqtt.publish
     data_template:
       topic: homeassistant/light/ESP-3dc22b/effect/speed/set
       payload_template: "{{ trigger.to_state.state | int }}"
   
- alias: Gyver Scale
 trigger:
   platform: state
   entity_id: input_number.scale
   
 action:
   - service: mqtt.publish
     data_template:
       topic: homeassistant/light/ESP-3dc22b/effect/scale/set
       payload_template: "{{ trigger.to_state.state | int }}"

вынеси, в чем проблема-то?

Только напиши сначала

automation:
  - alias: Gyver Speed

А это в в configuration:

input_number:
 speed:
   name: Speed
   initial: 30
   min: 0
   max: 255
   step: 1

 scale:
   name: Scale
   initial: 30
   min: 1
   max: 100
   step: 1

лично я так использую
automation:     !include_dir_merge_list includes/automations

так можно разбивать по файлам

я я так:

homeassistant:
  packages: !include_dir_named packages/

какая разника как кто использует. человеку нужно помочь

Да у меня так и есть, я не совсем понял эту конструкцию