Думаю, там протокол свой не стали придумывать, поэтому там tOTP; он в общем норм.
А приложение/токен свои в основном для удобства (а на самом деле — для прикипания пользователей к бренду). Они либо white label чего-то готового (и тогда они скорее всего норм, но апдейты могут запаздывать если какой-то косяк таки всплывёт), либо самопальные — и вот тогда пизда рулю