Не знаю, имеет ли что-то общее, но тоже поделюсь. У меня такая же проблема на хакинтоше при работе с дискреткой. Тоже в блендере, в юнити небольшие писки появляются. После многочисленных опытов пришел к выводу, что это проблема аудиокодека.
На винде такого нет, но там и звук намного хуже.