Я пробовал удалять одну вершину, и там была одна, или еще как-то можно проверить?
Тоже вариант.
Тогда выдели всё - alt+m - by distance
А ещё советую разобраться, почему у тебя они возникли. Как так получилось, что ты моделируешь, моделируешь, вроде всё сделал, а тут оп, и глюк.