Посмотрел самые первые картинки. Only vertices не стоял. Ладно.
Но ещё одна причина, из-за чего модификтор может "не работать", это из-за clamp overlap. Эта галочка проверяет, что при создании фасок полигоны не выворачивало. Она не позволит увеличить размер фаски больше допустимого.
А допустимый размер фаски у тебя оказался очень мал из-за близко расположенных вершин где-то в модели. Если убрать галочку, то размер можно смело увеличивать, но где-то в модельке будут кривые полигоны.