Так в итоге куда? Модуль Home?

Вот по разделению на модули лекция, очень подробно. https://youtu.be/xT25xiKqPcI

Да. Функция "Home" вполне ясна, это заглавная страница приложения. Часто ещё и одна из самых насыщенных функциональностями )

Я видел это видео как раз тогда и зацепился слухом что много копипасты будет

Мы тоже в проекте используем похоже разделение, только всегда проблема куда воткнуть хелперы базовые объекты компоненты
Которые не относятся к конкретному модулю.

Какая копипаста? Если у тебя много копипасты то это признак плохого дизайна. Значит где-то криво поделил на модули.

Я про то видео, там как раз про копипасту и говорили

А не следует из второго пункта, что контроллер должен быть вне модуля? К примеру у нас есть модуль пользователя и модуль оповещений. Модулю оповещений нужен номер телефона пользователя (модулю пользователя этот телефон не нужен). С другой стороны у нас есть UI, который должен быть user friendly, т.о. хотим менять email (из модуля пользователя) и phone (из модуля оповщений) в одной форме.

Связанные между собой классы объединяешь в модуль. Несвязанные можно побить по тематике и тоже сгруппировать в модули. Всё.

Это проблемы от неопытности.

Как делаешь, если двум классам нужен один и тот же код, но сами классы не должны быть связаны между собой? Создаёшь третий класс и выносишь туда этот код.

Так же и с модулями. Делай ещё один модуль Profile который будет отвечать за редактирование всего набора этих данных - предоставлять форму, вьюхи, контроллеры.

При записи этого профиля есть варианты:

1. Дублируешь инфу и пишешь в profile и одновременно в три таблицы, зато читаешь всегда из одной.

2. Не дублируешь инфу и раскладываешь эти поля по разным таблицам, а при просмотре и загрузке в форму извлекаешь из них собирая воедино.

Выбрать по вкусу.

Есть компонент нотификации который  может слать в почту дискорд телегу и тд.

Лучше такое одиночное в пакеты выносить наверное композера?

В пакет композера лучше выносить то что будет однозначно переиспользоваться между проектами. Но надо очень хорошо продумывать дизайн классов, чтобы и подключалось удобно и польза от пакета была ощутимой.

Было бы любопытно посмотреть на твой рефакторинг demo в рамках этого issue

Вот мы и приходим к бандлам, как у симфы :)

Звучит так, будто это что-то плохое

Но вообще в симфони в бандлы раскидывается только то, что железно будет переиспользовано. Т.е. в данном случае разницы нет

Проблемы с конфигурированием - самая частая проблема этих бандлов.

что их делают недастаточно расширяемыми? или что?

Про масштабирование я ничего не говорил. Я говорю за проблемы с конфигурированием.