Нужен именно штамп, а не листик в клеточку с регистрацией.
Если стоит, то заходите на сайт консульства Японии в РФ, выбираете тип визы "посещение родственников" и готовите все документы, которые там перечислены + на всякий делаете ксерокс ВНЖ. И с этим всем идете в консульство и получаете визу