Индексироваться они будут одинаково. Но индексация - это всего лишь наличие в индексе.
Может быть, вы имели в виду продвигаться в органике?
Для продвиги нужна скорость загрузки страницы и ее сеошная и техническая оптимизация.
На элементоре страницы довольно грузные, и со скоростью загрузки у них не факт, что будет гладко.
Выглядят их потроха непривлекательно. А поисковик это все лопатит ведь. Мало ли, что там в кишках - какие-то скрипты,ну, черт его знает. А чтобы поисковику понравиться, нужно быть чистеньким, понятненьким.
Плюс иное/остальное: AMP, турбо. Этого всего не будет. Да ничего не будет из того, что вордпресс дает для продвиги. Всякие микроразметки. Кто это будет на элементоре делать?
Вывод: конечно, не полетит против качественной верстки-то.