А про пошагово, когда в админке во вкладке 'Обновление' (../wp-admin/update-core.php), нажимаю кноgку "Обновить" что происходит , я так понимаю судя по url он (wp) обращается к файлу ../wp-admin/upgrade.php и тут я потерялся, под каким пользователем, кто куда идет куда качает. Однако, пока не сделал владельцем /var/www пользователя www-data (что было по умолчанию) обновление не проходило, сейчас после смены пользователя все прошло, спасибо за ответ,Еще поэкспериментирую, если что узнаю , отпишу