У майна JVM создает примерно 16 отдельных потоков к дополнению к майновской логике например. Игровая логика в отдельном потоке (с 1.3.1), сетевая жопа тоже, нахождение пути мобами в отдельном потоке (с 1.8), генерация мира тоже в другом (с 1.13) и много чего еще
Точно сказать трудно, все же сурсы закрытые и единственный вариант понять че происходит — дебажить)