Ну, потому что отличаются, наверное? И соединяет их лишь несколько отсылок к первой части, а сюжетно их связывает только наличие одних и тех же глобальных организаций
Ну, как минимум то, что самая базовая механика взлома чего-либо в первой части была "зажмите кнопку", а во второй стала "нажмите и выберите", что по сути делает геймплейные возможности шире