VA сейчас заточена под наиболее частый сценарий - и в нём пользователю удобнее, когда настройки сами загружаются при старте
На CI - да, нужно дать возможность это отключить, т.к. там всё явно передаётся через json.
При передаче базы - наверное стоит объяснить принимающей стороне, что настройки загрузятся из базы.
Ок, на CI параметром отключаем загрузку ранее сохраненных настроек, при этом они после отработки сценария будут сохранены в ИБ (новые настройки), или нет и останутся старые?
Путь "передать ИБ, объяснить, что автоматом загрузятся настройки, с которыми надо поступить так-то, потому что ..., а если потеряется работоспособность, то необходимо будет ..." безусловно можно использовать. Но я лентяй (в душе как минимум :) ) и потому предпочту просто все настройки очистить и отдать "пустую ИБ" без лишних объяснений.