Если конфа у вас типовая и вы планируете обновляться, то данные лучше не сериализовать.
Данные можно и нужно сериализовать.
Только использовать правильные инструменты, а не выгрузку в хмл типовыми средствами. Типовая выгрузка очень жестко зависит от метаданных и быстро ломается при изменении любого реквизита.
А правильные инструменты позволяют держаться на плаву и не слишком зависеть от изменения метаданных.
Например, Генератор данных из Ванесса.АДД