Журналируемой ФС должно быть пофиг, в принципе.
У субд своя структура, ей пофиг на фс (кто помнит оракл raw?) и они используют теже принципы сохранения (журналы и проч) а ещё много чего в ram хранится... в общем случае, обычно беред файловым бекапом надо бд в ридонли перевести как минимум и кеши сбросить, но это бэкап софт и прочие скрипты должны уметь.
Позволит ли ваш бизнес залочить бд на запись на время бэкапа?