Посмотрел презу. Я бы эту рекомендацию трактовал скорее как "не используйте двунаправленные связи там, где они не нужны", чем "старайтесь их не использовать везде". Они, действительно требуют дополнительных ресурсов и могут быть критичны в условиях highload, но при этом они добавляют немало удобства в работе. Там где требования оптимизации не стоят на первом плане, я бы не отказывался от них, если с ними удобнее.