Всем привет! Меня зовут Таня и аспирант кафедры клеточной биологии и гистологии биофака МГУ.
У меня возник небольшой вопросик и мои друзья посоветовали мне попытать счастья в вашем чате.
Вопрос вероятно к специалистам по генетике/биоинформатике/молекулярной биологии.
Есть гены, которые экспрессируются в определенных клетках у арабидопсиса. Мне необходимо выяснить, есть ли экспрессия этих или сходных генов в аналогичных клетках у пшеницы.
Поскольку геном пшеницы секвенирован, но не то, чтобы очень хорошо и данных по генетике пшеницы всяко меньше, чем у арабидопсиса, прямой поиск подобных генов через pubmed мало что даёт.
Я пыталась проводить поиск, через специализированные базы данных растительных генов, мне очень понравилась
база данных Plaza
https://bioinformatics.psb.ugent.be/plaza/Но очень часто при поиске на один ген арабидопсиса вылезает целый список гомологов и ортологов у пшеницы, и я не очень понимаю, чем руководствоваться при выборе лучшего.
Была бы благодарна, если бы кто-то помог мне прояснить этот вопрос.