ML
есть даже тулы для такого, хотя я обычно без автоматизации обхожусь
Size: a a a
2021 May 09
A
а можете подсказать тулы? а то я чувствую буду долго тупить. В какую сторону гуглить. Я вот допустим нашел в ген банке геном родственной бактерии одной пока что
ML
ну вот, например: https://services.birc.au.dk/prifi/main.py вроде рабочий. Их много наделали, но как и все веб-сервисы, они дохнут быстро
A
спасибо
DR
Хотел предложить базу готовых олигов, а она сдохла.
E
Надо на распределение первой цифры смотреть, а не последней.
https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%97%D0%B0%D0%BA%D0%BE%D0%BD_%D0%91%D0%B5%D0%BD%D1%84%D0%BE%D1%80%D0%B4%D0%B0
https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%97%D0%B0%D0%BA%D0%BE%D0%BD_%D0%91%D0%B5%D0%BD%D1%84%D0%BE%D1%80%D0%B4%D0%B0
ML
насчет поиска родственников - ну вот, представим себе, что это интересующий вас геном: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/57131?genome_assembly_id=328764 Идете на ступень (две, три) выше в lineage и дальше кликаете справа в related information на assembly
A
я вот сейчас попробовал еще просто с одного родственного генома сделать бласт с интересующим геном и он нашел кучу похожих родственных, видимо тоже рабочий вариант
ML
да, как вариант. Зависит от того, с чего удобнее начинать, с гена или с генома. Бласт проще, но может вытащить кучу неполных последовательностей или ещё какого-нибудь мусора
A
понятно, спасибо за помощь, стало намного понятнее в целом что делать
O
Кхм, я тут конечно ленивый и не читал все 100500 сообщений, но как это может быть не этично, если тебе надо связаться с конкретным человеком, и у тебя из контактов только фб? Соцсети же для того и сделаны, чтобы люди больше общались?
PN
АП
Отвечу сам) Там проблема в том, что я не запрашивал у человека его фб, а нашел его по электронной почте и другим данным, которые мне доверили.
АП
И это как минимум вызывает дискомфорт у людей, а как максимум ставит под вопрос нашу политику работы с перс.данными
ML
Ну вот тут звучало такое мнение, что писать по любым контактам, которые тебе не давали и которые ты сам нашёл - неэтично и незаконно. Я это мнение не разделяю, если что)
АП
Часть людей реагировало совершенно спокойно на такие сообщения, но как видно выше, для части это не приемлемо. И я безусловно хочу уважать из мнение и личное пространство в сети.
O
Если это открытые данные, то почему нет? Но да, если это нарушение работы с перс данными - это другое
MD
Какой, если уж решили заявить?
Н(
+
Сделал общедоступную соц.сеть? Не удивляйся, если тебе напишут
Умные люди указывают "тут общаюсь только по личным вопросам, с рабочей перепиской на почту" и подобное
Сделал общедоступную соц.сеть? Не удивляйся, если тебе напишут
Умные люди указывают "тут общаюсь только по личным вопросам, с рабочей перепиской на почту" и подобное
АП
Новая этика, мне не давали разрешения обращаться не через почту. Тут тонкая грань вероятно, если бы я писал в сеть для профессионального общения, то результат был бы (и был в случае например LinkedIn) другой